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资源类型: 中文期刊
关键词:核苷酸序列(模糊匹配)
共2条记录
一个侵染山东大葱的胡葱黄条病毒分离物的鉴定

《病毒学报 》 2006 北大核心 CSCD

摘要:在山东章丘大葱上发现了一种引起畸形黄条症状的线状病毒。该病毒容易摩擦接种侵染大葱和胡葱,但不侵染其它22种测试植物,能经由豌豆蚜传播。病毒粒子形态和细胞病理特征具有马铃薯Y病毒科成员的典型特征。Western blot分析表明,提纯病毒制备的抗血清能与病毒自身外壳蛋白起特异性的强反应,与薤花叶病毒、晚香玉轻斑驳病毒、小西葫芦黄花叶病毒和芋花叶病毒外壳蛋白有较弱的反应。采用马铃薯Y病毒科简并引物PCR技术扩增了该病毒的基因组3′-末端部分序列,序列比较表明它为胡葱黄条病毒(SYSV),系统进化树分析表明世界范围内的SYSV分离物可以区分为4个主要群体,在一定程度上与寄主植物种类及地理分布相关。

关键词: 胡葱黄条病毒 普通生物学鉴定 血清学 核苷酸序列 系统进化树分析

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我国大蒜潜隐病毒的基因组结构及3’端序列的变异

《中国科学(C辑:生命科学) 》 2002 北大核心 CSCD

摘要:从我国6个省市12个大蒜样品上共检出10个不同的香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)分离物,测定了浙江分离物ZJ1的基因组全序列和其他9个分离物的基因组3'端序列.ZJ1分离物RNA基因组全长8363个核苷酸,3'端具polyA尾,含6个可读框(ORF),分别编码复制酶,TGB1,TGB2,TGB3,CP和NABP,基因组结构和其他Carlavirus属成员相似.序列分析表明,10个分离物均为大蒜潜隐病毒(GarLV),不同分离物TGB2,TGB3和NABP的差异大于CP的差异,且这些分离物和葱潜隐病毒(ShLV)也具有很高的同源性.系统进化树分析表明,大蒜来源的GarLV分离物可以分成4个类群,我国分离物分别属于4个不同类群.

关键词: 大蒜潜隐病毒 核苷酸序列 基因组结构 变异

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