大白菜EST-SSR标记开发中非SSR标记的鉴别

周新成; 刘立峰; 李化银; 高建伟; 《山东农业科学 》 2010

摘要：EST-SSR标记开发过程中经常会遇到一些问题,例如引物重复设计等。本试验对从大白菜EST序列中开发的30个多态性SSR标记产生的多态性条带进行测序,结果发现有一些标记的多态性并不是由于其所含有的简单重复序列重复次数的改变引起的,这类标记约占鉴定标记总数的13%。这些标记实际上属于EST-SCAR标记。在进行SSR变异对基因表达及功能影响方面的研究时,这类非SSR标记应该被排除。

关键词： EST-SSR 标记开发 多态性 测序 大白菜