科研产出
牛粪高温堆制过程中细菌和真菌多样性变化分析
《山东农业科学 》 2021
摘要：高温堆肥是规模化养殖条件下畜禽粪便无害化转化的重要途径,但堆制过程中微生物驱动机制并不清晰。本研究基于Illumina平台高通量测序技术,分析了牛粪发酵升温期（IM）、高温期（TH）、降温期（CO）和熟化期（MA）细菌和真菌种群的多样性变化。4个时期样本共得到965个细菌OTU和164个真菌OTU。细菌CO期和MA期的OTU数比IM期及TH期大幅度提高,真菌TH期和MA期的OTU数比IM期和CO期明显增加。与IM期比较,细菌门水平TH期、CO期和MA期Actinobacteria（放线菌门）相对丰度明显提高,而Bacteroidetes （拟杆菌门）和Firmicutes（厚壁菌门）相对丰度大幅度下降;真菌门水平TH期、CO期和MA期Ascomycota （子囊菌门）相对丰度明显提高,TH期Zygomycota（接合菌门）和Basidiomycota（担子菌门）相对丰度大幅度增加。细菌属水平菌群分析表明,与IM期相比,TH期、CO期和MA期Pedobacter（土地杆菌属）、Pseudomonas（假单胞菌属）、Psychrobacter（嗜冷杆菌属）相对丰度大幅度下降,TH期Sphingobacterium（鞘氨醇杆菌属）、Pseudoxanthomonas（假黄色单胞菌属）、Thermovum（嗜热菌属）和Bacillus（芽孢杆菌属）相对丰度大幅度增加。TH期真菌属水平的优势菌群为Mortierella（被孢霉属）和Emericella（裸胞壳属）。综上,细菌和真菌的演替模式不同,二者共同驱动了高温腐熟进程。
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16S rRNA基因高通量测序方法检测奶牛场常用干草表面微生物群落结构及多样性
《微生物学通报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】随着中国奶牛业的发展,干草需求量与日俱增。作为天然牧草,干草可以成为家畜传播病原体的载体。以干草表面附着物为研究对象,了解干草中细菌群落结构以及致病菌属特征。【方法】对来自6个不同奶牛场饲草舍的干草样本,应用Illumina Mi Seq高通量测序技术测定干草表面附着物细菌的16S r RNA基因V3-V4变异区序列,分析不同干草样本细菌群落组成。【结果】干草样本中的细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为15 416,涵盖了29门87纲144目219科323属的细菌。微生物多样性分析表明,干草样本具有很高的细菌多样性,不同样本多样性存在差异。对干草样本菌群中丰度较高的14种病原菌属进行分析,发现相较于人工种植牧草制备的干草,天然牧草制备的干草中病原菌属丰度较高。【结论】研究解析了干草样本中微生物的多样性、丰度及主要病原菌属的特征,对奶牛场疾病防控有一定指导意义。
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