文献类型: 中文期刊
作者: 张阁 1 ; 孙翠丽 1 ; 彭永 1 ; 程汝佳 1 ; 杨宏军 1 ; 朱良全 1 ; 胡莉萍 1 ; 丁家波 1 ;
作者机构: 1.中国兽医药品监察所;山东农业大学动物科技学院;山东省农业科学院奶牛研究中心;山东省动物疫病预防与控制中心
关键词: 干草;微生物群落及多样性;MiSeq测序
期刊名称: 微生物学通报
ISSN: 0253-2654
年卷期: 2017 年 12 期
页码: 2847-2855
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】随着中国奶牛业的发展,干草需求量与日俱增。作为天然牧草,干草可以成为家畜传播病原体的载体。以干草表面附着物为研究对象,了解干草中细菌群落结构以及致病菌属特征。【方法】对来自6个不同奶牛场饲草舍的干草样本,应用Illumina Mi Seq高通量测序技术测定干草表面附着物细菌的16S r RNA基因V3-V4变异区序列,分析不同干草样本细菌群落组成。【结果】干草样本中的细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为15 416,涵盖了29门87纲144目219科323属的细菌。微生物多样性分析表明,干草样本具有很高的细菌多样性,不同样本多样性存在差异。对干草样本菌群中丰度较高的14种病原菌属进行分析,发现相较于人工种植牧草制备的干草,天然牧草制备的干草中病原菌属丰度较高。【结论】研究解析了干草样本中微生物的多样性、丰度及主要病原菌属的特征,对奶牛场疾病防控有一定指导意义。
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