我国大蒜潜隐病毒的基因组结构及3’端序列的变异

陈炯; 陈剑平; 郑红英; 杨崇良; 《中国科学(C辑:生命科学) 》 2002 北大核心 CSCD

摘要：从我国6个省市12个大蒜样品上共检出10个不同的香石竹潜隐病毒属（Carlavirus）分离物,测定了浙江分离物ZJ1的基因组全序列和其他9个分离物的基因组3＇端序列.ZJ1分离物RNA基因组全长8363个核苷酸,3＇端具polyA尾,含6个可读框（ORF）,分别编码复制酶,TGB1,TGB2,TGB3,CP和NABP,基因组结构和其他Carlavirus属成员相似.序列分析表明,10个分离物均为大蒜潜隐病毒（GarLV）,不同分离物TGB2,TGB3和NABP的差异大于CP的差异,且这些分离物和葱潜隐病毒（ShLV）也具有很高的同源性.系统进化树分析表明,大蒜来源的GarLV分离物可以分成4个类群,我国分离物分别属于4个不同类群.

关键词： 大蒜潜隐病毒 核苷酸序列 基因组结构 变异