谷子基因组SSR信息分析和标记开发

张晗*; 王雪梅*; 王东建; 孙加梅; 杨延兵; 段丽丽; 李华; 宋国安; 王晓宇; 李汝玉; 《分子植物育种 》 2013 CSCD

摘要：对从Phytozome数据库中获取的谷子基因组序列进行搜索,在21150.78kb序列中发现2872个SSR,平均每7.36kb就有一个SSR;共发现126种重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸类型分别占63.41%和31.86%。初步设计了74对SSR引物,其中64对引物可以稳定扩增。利用40对引物对27份谷子品种进行多态性检验,27对引物扩增良好且多态性丰富,共扩增出220个等位变异,平均每个位点8.15个。

关键词： 谷子 基因组序列 SSR 多态性