科研产出
猕猴桃扩展蛋白基因家族鉴定及不同胁迫表达
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：扩展蛋白是细胞壁的重要组成部分，具有疏松细胞壁、增加细胞壁柔韧性的作用，广泛存在于植物基因组中。本研究以中华猕猴桃(Actinidia chinensis)‘红阳’基因组序列为基础，通过毛果杨扩展蛋白序列进行特征结构域比对从而获得猕猴桃扩展蛋白序列信息。通过生物信息和密码子分析软件对猕猴桃扩展蛋白基因进行研究，从而得到基因家族特征和密码子偏好信息。猕猴桃扩展蛋白基因家族包含39个成员，分属于AcEXPA (28)、AcEXPB (6)、AcEXPLA (1)和AcEXPLB (4) 4个亚家族，其中的36个成员定位于22个染色体中。氨基酸组成分析显示，Gly含量最高(11.74%)，而His含量最低(1.91%)。密码子特性分析显示，猕猴桃扩展蛋白第3位碱基更偏好使用嘧啶类，序列GC值趋向于平均使用。通过同义密码子相对使用频率分析发现，扩展蛋白共有高频密码子8个，且均以G/C碱基结尾。对猕猴桃植株进行逆境胁迫处理后分别有3、14、7、6个基因参与低温、高温、干旱和盐胁迫响应。通过对猕猴桃扩展蛋白基因家族的鉴定和密码子用法及功能分析有利于认识其在猕猴桃基因组中的组成特点、表达效率特点，也为今后扩展蛋白在猕猴桃中的作用以及异源表达研究提供一定基础。
关键词： 猕猴桃(Actinidia chinensis) 扩展蛋白 基因家族 密码子偏性 基因功能
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集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803 slr1501的克隆及原核表达分析
《山东农业科学 》 2019
摘要：组蛋白乙酰基转移酶上调表达与抗逆性有一定相关性。集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803 Slr1501是一个未知蛋白,预测其属于组蛋白乙酰基转移酶GNAT家族N-乙酰基转移酶。为了进一步明确slr1501基因功能,本研究从集胞藻6803中克隆slr1501基因,成功构建了pET-28a(+)-slr1501原核表达载体,并转化至大肠杆菌BL21(DE3)进行分析。经1 mmol/L IPTG诱导2 h后Slr1501蛋白成功表达,表达量随诱导时间的延长而增加,且主要以包涵体形式表达。Western blot检测结果显示Slr1501重组蛋白特异性表达。本试验结果为进一步研究该基因的功能奠定了基础。
关键词： 集胞藻6803 乙酰基转移酶 slr1501 原核表达 基因功能
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基因沉默技术及其在棉花中的应用
《分子植物育种 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：基因沉默是指生物体内基因表达调控的重要手段,主要表现为特定基因的表达量下调或表达受到抑制。基因沉默主要有两种,转录水平上的基因沉默和转录后基因沉默。前者主要包括基因甲基化、位置效应、同源基因的反式失活、后成修饰作用以及重复序列引起的基因沉默;后者主要包括共抑制和RNA干扰引起的基因沉默。基因沉默广泛存在于植物体中,是一种基因表达调控和抵御病毒侵害的重要机制。文中介绍了基因沉默的类型和作用,重点评述了基因沉默技术在植物基因功能研究,尤其在棉花种质创新与品种改良方面的应用进展。
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VIGS技术及其在棉花功能基因组研究中的应用进展
《棉花学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：病毒诱导的基因沉默(Virus induced gene silencing,VIGS)是一种转录后基因沉默现象,是植物体内普遍存在的遗传免疫机制,现已被开发为快速、高效、高通量的反向遗传学技术,在植物基因功能研究中得到广泛应用。近年,利用VIGS技术进行棉花基因功能研究也取得了一定进展。本文对VIGS技术的发展、操作技术的优化进行了综述,尤其总结了VIGS技术在棉花抗病、品质改良、生长发育等基因鉴定和功能研究中的应用进展,并对其应用前景进行了展望。
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