科研产出
山东省某规模化兔场GI.1a型兔出血症病毒的分子特性分析
《中国动物检疫 》 2024
摘要：2023年10月，山东省某规模化兔场（存栏2 000只母兔）免疫过兔出血症（RHD）疫苗的经产母兔出现精神不振、体温升高、猝死等情况。为查明发病原因，采集4只病死兔组织进行细菌分离培养和病原核酸检测，并对检出的1份阳性样品（命名为S1001）进行了兔出血症病毒（RHDV）分型鉴定及遗传进化分析。结果显示：未分离到细菌，4份病料均为RHDV阳性；经测序S1001属于RHDV GI.1a基因型，其p16、p23、p29、VP10基因均属于GI.1a分支；与疫苗株（NJ株）相比，VP60基因的核苷酸同源性为95.9%,p16、p23、p29、VP10等蛋白分别存在9、18、11、2处氨基酸变化。蛋白结构预测结果显示，S1001 VP60蛋白的N端片层结构区变化明显，与参考株结构相似性为93%,TM-score为0.59（越接近于1，结构越相似）。结果说明：该兔场存在RHDV感染，感染的RHDV与疫苗株相比存在较多分子差异，蛋白构象变化有可能导致VP60蛋白抗原性发生变化。建议持续加强RHDV的遗传变异监测，及时掌握病毒变异情况，以期为新型疫苗研发奠定基础。
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一株鸭新城疫强毒的分离鉴定和分子特性分析
《中国家禽 》 2011 北大核心
摘要：从山东地区发病鸭中分离到一株新城疫病毒(SDLP09),经测定,其鸡胚半数致死量(ELD50)、鸡胚平均死亡时间(MDT)、1日龄雏鸡脑内接种致病指数(ICPI)、6周龄鸡静脉接种致病指数(IVPI)分别为107.85/0.1mL、48.5h、1.80、2.36,表明该新城疫病毒为强毒。通过分析其融合蛋白(F)发现,F蛋白多肽裂解位点为112RRQKRF117,符合NDV强毒株裂解位点氨基酸序列。F基因分型及氨基酸同源性比较发现,SDLP09株属于基因Ⅶ型,与野鸭源强毒NDV同源性更高,提示着该毒株可能来源于野鸭。
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肉鸽新城疫病毒山东分离株的分离鉴定及其F基因的分子特性分析
《浙江农业学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：从山东某发病肉鸽的体内分离到一株新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV),命名为Pigeon-Shandong-JN-08(简写JN08),对其融合蛋白(fusion,F)进行序列和分子特性的分析,以了解肉鸽NDV的遗传起源和分子特性。JN08经病毒蚀斑克隆纯化后动物回归试验可产生典型的NDV病变。研究结果发现,F蛋白多肽裂解位点的序列为112RRQKRF117,符合鸽源NDV强毒氨基酸基序。F基因分型及同源性比较显示:JN08与绝大多数鸽源毒株同属于基因Ⅵ型;其F基因与基因Ⅱ型毒株LaSota,B1,Bingham,TEX-48氨基酸同源性为89.9%,89.7%,90.4%,89.7%,与基因Ⅰ型毒株Ulster67的氨基酸同源性为91.3%,与基因Ⅲ型传统强毒F48E9的氨基酸同源性为92.8%;与国内鸽分离株P1-03,CH98-98,JS1-06,PB01-96和GZ-07的氨基酸同源性分别为91.3%,94.6%,94.8%,95.1%,94.0%;与国外鸽分离株Capital3-97,Tigre6-99,1166-02,IT227-97,2736-00,NY-84,TX3503-04,248VB-98的同源性分别为96.2%,93.8%,98.0%,96.8%,97.1%,96.8%,96.8%,98.4%。从F基因遗传进化树上发现:JN08与国外分离株的遗传距离较近,处于同一基因亚型上,而与国内分离株的遗传距离较远。
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一株肉鸽强毒新城疫的分离鉴定和分子特性分析
《家禽科学 》 2009
摘要：从山东地区发病肉鸽中分离到一株新城疫病毒(SDZ08),经测定,其鸡胚半数致死量(ELD50)、鸡胚平均死亡时间(MDT)、1日龄雏鸡脑内接种的致病指数(ICPI)、6周龄鸡静脉接种的致病指数(IVPI)分别为107.85、52.5h、1.8、2.2,表明该新城疫病毒为强毒。通过分析其融合蛋白(F)发现,F蛋白多肽裂解位点为112RRQKRF117,符合NDV强毒株裂解位点氨基酸序列。F基因分型及氨基酸同源性比较发现,SDZ08株属于基因Ⅵ,与LaSota、F48E9、B1、V4等传统毒株同源性较低,与鸽源NDV同源性较高。
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高抗体水平种鸡NDV的分离鉴定和分子特性
《微生物学通报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要：从抗体水平较高、产蛋下降的种鸡群分离到一株新城疫病毒(Newcastle Disease virus,NDV)SGM01,经动物回归可产生NDV典型病变,其MDT、ICPI和IVPI等分别为50．5h、1．76和2．41,表明为强毒。对其F和HN基因进行克隆测序,F基因氨基酸多肽裂解位点的基序为~(111)GRRQKRF~(117),与强毒基序一致。基因分型表明SGMO1属Ⅶ型。氨基酸同源比较显示:SGM01与LaSota、SQZ04等基因Ⅱ型的同源性为:87．7%～88．3%;(?) Taiwan95、Yunnan03等基因Ⅶ型的同源性为:95．7%～98．2%;与F_(48)E_9等基因Ⅸ型的同源率为:90．8%～91．7%。HN基因与F基因不同,具有明显的时空性。SGM01、Taiwan95、SQZ04等新近分离毒氨基酸高度同源,同源性为:95．3%～97．2%,显著高于与LaSota(经典弱毒疫苗株)和F_(48)E_9(经典强毒株)的同源性87．4%～89．0%。
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一株信鸽新城疫强毒的分离鉴定和分子特性分析
《农业生物技术学报 》 2007 CSCD
摘要：从发病信鸽的体内分离到1株新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)PB9601,经病毒蚀斑纯化后动物回归试验可产生典型的NDV病变,其鸡胚平均死亡时间(MDT)、一日龄雏鸡脑内接种的致病指数(ICPI)、六周龄鸡静脉接种的致病指数(IVPI)分别为50.5h、1.65和2.36,表明NDV为强毒。对其融合蛋白(F)和血凝素神经氨酸酶(HN)基因分别进行克隆测序,发现F蛋白多肽裂解位点的氨基酸基序为112 KRQKRF 117,符合鸽源NDV强毒序列。F基因分型及同源性比较显示:PB9601与YN-03、TW-98等鸽源毒株属于Ⅵ型,其F基因与疫苗株基因Ⅱ型LaSota的氨基酸同源性为88.6%,与疫苗株基因Ⅰ型V4的氨基酸同源性为91.0%,与传统强毒基因Ⅸ型F48E9的氨基酸同源性为90.6%;与国内鸽分离株GX-05、YN-03和TW-98的氨基酸同源性分别为92.1%、95.5%和98.6%;与国外鸽分离株Capital3-97、Tigre6-99、1166-00、IT-227-82和2736-00的同源性分别为93.3%、91.9%、94.6%、95.1%和93.6%。HN基因氨基酸同源比较显示:PB9601与LaSota、F48E9和V4的氨基酸同源性分别为87.2%、89.2%和87.6%;与国外鸽分离株1166-00、IT-227-82和2736-00的同源性为93.7%、95.5%和92.3%。PB9601与国内外鸽分离株、LaSota、F48E9和V4相比,具有明显的地域性和种属性。
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