科研产出
进口白羽肉种鸡J亚群禽白血病病毒的全基因组序列分析
《中国预防兽医学报 》 2019
摘要：为研究引起我国部分地区进口白羽肉种鸡发生禽白血病疫情的病毒来源及其变异趋势,本研究对从进口白羽肉种鸡分离的8株J亚群禽白血病病毒(ALV-J)的全基因组序列进行测序分析.8株ALV-J gp85氨基酸遗传演化分析显示,其与ALV-J肉鸡分离株(包括ALV-J原型病毒株HPRS-103、美国肉鸡ALV-J分离株、国内肉鸡分离株)及蛋鸡分离株氨基酸序列同源性均低于92.5%,而与国内2014年父母代白羽肉种鸡ALV-J分离株GD14J2同源性较高,为93.5%~95.1%,处于同一分支.8株ALV-J的3'非编码区(3'UTR)在r TM区缺失203 bp,DR-1区缺失7 bp,E元件位置缺失125 bp,仅保留了22个碱基,这一缺失特征与GD14J2一致.8株ALV-J的3'LTR U3区序列与ALV-J肉鸡分离株及蛋鸡分离株的相应基因序列同源性均低于91.5%,而与GD14J2病毒株的同源性较高,为94.3%~96.3%.序列分析发现U3区存在连续11 bp缺失和164位碱基突变(C/T),该突变形成2个新的转录调控元件AIB REP1、AIB REP2.综合gp85、3'UTR和U3区序列特征,推测引起本次进口白羽肉种鸡禽白血病的ALV-J与国内2014年父母代白羽肉种鸡ALV-J分离株GD14J2为同一来源.但本次分离到的ALV-J病毒株也有新的变异趋势,这些变异是否与ALV-J致病性相关,还需进一步研究.本研究为ALV-J有效防控和净化提供数据支持.
关键词： 进口肉种鸡 禽白血病 J亚群禽白血病病毒 全基因组序列分析
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一株新亚群禽白血病病毒全基因组序列分析
《畜牧兽医学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：为了解外源性禽白血病病毒(ALV)在山东省部分地区肉鸡中的流行状况,采集无菌抗凝血分离血浆接种DF-1细胞、ELISA p27抗原检测以及DNA提取进行PCR扩增等方法,从山东省某地区大型养殖场不同个体养殖场出栏肉鸡群中分离鉴定出1株ALV,命名为FC1505。分析其囊膜糖蛋白gp85氨基酸序列与近年来从地方品种鸡中疑似新亚群ALV-K分离株的相似性最高,相似性均在95%以上,而与其他已知亚群ALV的相似性均低于90%。为了进一步分析该分离株分子特性,对其进行全基因组测序,并与已知亚群ALV分离株序列进行比较。结果表明,FC1505分离株整个基因组中gag、pol和gp37基因相对保守,与ALV参考毒株序列相似性都在90%以上,但均与疑似K亚群的ALV分离株相似性最高;全基因组序列分析进一步说明FC1505属于ALV-K。本研究继我国江苏省和华南地区K亚群ALV报道后,首次从山东地区肉鸡中鉴定到一株ALV-K并完成其全基因组序列分析。
关键词： 商品肉鸡 禽白血病病毒 分离鉴定 全基因组序列分析
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