文献类型： 中文期刊
关键词： 丹参;基因组SSR;HiSeq 2000;微卫星;多态性
期刊名称： 时珍国医国药
ISSN： 1008-0805
年卷期： 2019 年 04 期
页码： 970-972
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 目的通过开发丹参基因组SSR标记并验证其有效性,为丹参的分子标记的开发应用提供依据。方法利用Illumina-HiSeq 2000高通量测序技术对山农丹参1号(SNDS1)进行简化基因组测序,对得到的序列利用生物信息学手段进行拼接后查找开发SSR;利用PCR技术检测引物扩增效率。结果共获得2.40Gb的丹参基因组序列,设计开发重复单元长度为2～6碱基的SSR 6000多个;其中2碱基重复和3碱基重复的微卫星单元较丰富;合成600对SSR引物,在丹参上的有效扩增率达85%,经双亲和杂交子代验证其中53%以上的标记具有多态性。结论开发的基因组SSR具有较高的多态性,这在一定程度上大大丰富了在丹参上可以利用的基因组SSR标记。
- 相关文献
[1]SSR和STS标记在花生栽培品种鉴定中的应用研究. 张建成,王传堂,杨新道. 2006
[2]4个肉牛品种微卫星多态性分析. 张相伦,游伟,靳青,刘晓牧,谭秀文,万发春,曹顶国,刘桂芬. 2018
[3]丹参种子航天诱变的SP1生物学效应研究. 单成钢,倪大鹏,王维婷,张教洪,苏学合,朱彦威,王志芬. 2009
[4]基于五杆机构的丹参膜上移栽机构设计与试验. 徐高伟,刘宏新,荐世春,史嵩,何腾飞. 2018
[5]丹参种子航天搭载的诱变效应研究. 王志芬,单成钢,苏学合,闫树林. 2007
[6]丹参膜上倾斜移栽机构设计与试验. 徐高伟,刘宏新,FARMAN A C,方会敏,荐世春,何腾飞. 2019
[7]光伏-丹参生产模式下的光照变化及其对丹参生长的影响. 单成钢,王宪昌,张教洪,马炳鹏,李桂祥,倪大鹏,朱彦威,王志芬. 2018
[8]丹参种子特性研究. 单成钢,张教洪,王光超,张锋,倪大鹏,朱彦威,王志芬. 2013
[9]丹参田花期昆虫群落结构及多样性研究. 王玉芹,丁文静,刘岩,卢增斌,卢亚菲,于毅,郭文秀. 2020
[10]种植方式和密度对丹参生长发育及产量的影响. 韩守萍,倪大鹏,朱京斌,朱彦威,单成钢,王志芬. 2009
[11]间作玉米对丹参生长的影响. 邓国生,李晓天,张徽,任卫国,张教洪,王宪昌,单成钢. 2017
[12]丹参主要化学成分及提取分离方法研究进展. 李颖,赵增成,林树乾,黄中利. 2021
[13]丹参药材蛋白质提取工艺的优选研究. 刘杨,包华音,李巧玉,张锋. 2014
[14]遮阴胁迫对丹参生长及光合特性的影响. 陈晖,郭宝金,任丽华,高秋美,孟庆峰,韩金龙,王志芬. 2017
[15]丹参组织培养及其再生体系的建立与优化. 王维婷,单成钢,房翠萍,倪大鹏,朱彦威,黄萌,王志芬. 2011
[16]蒙山丹参耐阴性试验研究. 丁文静,张谦,陈香艳,张峰. 2015
[17]卫星搭载处理丹参种子SP_2代的SRAP分析. 王维婷,单成钢,倪大鹏,王志芬. 2009
[18]山东省丹参药材产业现状与发展策略. 王志芬,刘喜民. 2012
[19]正交试验法优选丹参高产施肥模式. 单成钢,倪大鹏,张教洪,王光超,张锋,朱彦威,王志芬. 2013
[20]丹参垄作对土壤耕层温度的影响. 单成钢,朱彦威,倪大鹏,朱京斌,王志芬. 2012
