文献类型： 中文期刊
作者： 唐桂英 1 ; 彭振英 1 ; 徐平丽 1 ; 李鹏祥 1 ; 朱洁琼 1 ; 单雷 1 ; 万书波 1 ;
作者机构： 1.山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生理生态重点实验室
关键词： 花生;ARF基因家族;系统进化分析;蛋白保守结构域;表达分析
期刊名称： 中国油料作物学报
ISSN： 1007-9084
年卷期： 2020 年 42 卷 006 期
页码： 1100-1110
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 生长素响应因子(Auxin response factor,ARF)是生长素信号转导途径中的一类重要转录因子,在种子萌发、器官形成、果实成熟、胚胎发生等多个生长发育过程发挥作用.为了揭示花生基因组中AhARF基因家族的特征,本研究利用生物信息学方法从花生基因组中鉴定了62个花生AhARF家族基因,它们不均匀分布于除1号和11号之外的其他18条染色体上,在A和B亚基因组对应关系的染色体上数目大体相同.依据系统发生关系,62个花生AhARFs与拟南芥AtARFs家族基因共同聚在除ClassIII(仅包含拟南芥AtARFs)外的其余4个分支.共线性分析共检测到33对片段重复基因,其Ka/Ks比值均小于1,受到环境压力的纯化选择.本研究还分析了它们的理化性质、蛋白保守结构域等特征.此外,基于22个组织转录组数据,绘制了62个花生AhARF家族基因的表达模式热图.进一步应用qRT-PCR方法,分析了可能与萌发相关的4个AhARF基因(AhARF10、AhARF20、AhARF23和AhARF46)的时空表达模式.本研究可为种子萌发相关AhARF基因的挖掘与功能鉴定提供基础.
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