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碱蓬PEPCase基因的克隆与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈明娜 1 ; 杨庆利 1 ; 禹山林 1 ; 秦松 2 ;

作者机构： 1.山东省花生研究所

2.中国科学院

关键词： 碱蓬(Suaeda glauca);磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因(PEPCase基因);RACE;基因克隆;序列分析

期刊名称： 海洋科学

ISSN： 1000-3096

年卷期： 2009 年 33 卷 06 期

页码： 69-74

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术首次获得碱蓬(Suaeda glauca)中含PEPCase基因完整编码区的cDNA序列,长度为3 038 bp。获得的序列采用生物信息学方法和系统进化方法进行分析。结果表明,获得的cDNA序列包含2 898 bp的完整开放阅读框,编码的966个氨基酸序列含有两个PEPCase活性位点以及6种其他的活性位点;预测蛋白质的相对分子质量为109 785.3,等电点为5.51,属于不稳定的亲水性蛋白;含量相对较多的氨基酸是Leu、Glu、Arg、Asp、Ser,不含Pyl和Sec;不包含跨膜结构和信号肽序列,推断为非分泌性蛋白;二级结构以α螺旋为主,三级结构为紧密球状结构;分析结果还表明获得的碱蓬PEPCase基因应该属于C3型。通过对碱蓬PEPCase基因的克隆及序列分析从而为后期碱蓬PEPCase蛋白表达的研究及获得高油量的转基因碱蓬植株奠定了基础。

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