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新城疫病毒山东分离株F和HN基因克隆与进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨少华 1 ; 胡北侠 1 ; 黄艳艳 1 ; 许传田 1 ; 颜世敢 1 ; 张秀美 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 新城疫病毒;基因型;强毒株

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2011 年 24 卷 04 期

页码： 1547-1551

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选取山东2007～2008年的5株NDV流行株,克隆融合蛋白(F)和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因全长并测序。结果表明,5个分离株F基因长度为1662 bp,编码553个氨基酸。F蛋白裂解位点的氨基酸序列均为112R-R-Q-K-R-F117,符合强毒株F基因裂解位点的氨基酸序列特征。对F基因47～420 nt序列进行比对,发现4株鸡源毒株基因型为Ⅶd,另一鸽源毒株基因型为Ⅵ。5个分离株间F基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为88.8%～99.7%和94%～99.3%,与LaSota、Clone30、F48E9的氨基酸同源性分别为88.4%～89.5%、87.7%～88.8%、90.8%～92.4%。HN基因长度为1801bp,编码571个氨基酸,5个毒株均含13个半胱氨酸残基且位置保守。与LaSota的氨基酸同源性为87.2%～88.8%,与8个山东NDV流行株的同源性为89.8%～98.6%。

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