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大白菜高通量SSR标记鉴定体系的建立和应用

文献类型: 中文期刊

作者: 张晗 1 ; 王东建 1 ; 孙加梅 1 ; 郑永胜 1 ; 姚凤霞 1 ; 许金芳 1 ; 宋国安 1 ; 段丽丽 1 ; 李华 1 ; 王雪梅 1 ; 李汝玉 1 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院作物研究所

关键词: 大白菜;SSR;品种鉴定;DNA指纹

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2014 年 15 卷 04 期

页码: 815-823

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 大白菜是重要的蔬菜作物,准确鉴定大白菜品种对于大白菜种质资源管理、新品种测试、种子质量检测等具有重要意义。本研究从已定位到大白菜10个连锁群的205个SSR标记中,筛选出30个在连锁群上分布均匀、PCR扩增稳定、带型简单的标记,用于大白菜品种DNA指纹鉴定。对入选的引物用4种荧光染料进行了标记,利用基于毛细管电泳荧光检测的DNA分析仪对SSR扩增产物进行检测。通过比较分析2种不同型号的3台DNA分析仪的扩增片段检测数据,明确了不同DNA分析仪的检测数据间一般存在明显的系统误差。系统误差的大小取决于引物,一般在1~4 bp之间。使用扩增产物的片段长度对各SSR位点的不同等位变异进行命名。通过使用一组参照品种,消除了不同批次、不同DNA分析仪型号间的系统误差,保证了检测数据的可重复性和可再现性。在此基础上,对184份大白菜品种进行了DNA分子数据采集。

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