文献类型： 中文期刊

作者： 阮建 ¹ ; 单雷 ² ; 李新国 ² ; 郭峰 ² ; 孟静静 ² ; 万书波 ² ; 彭振英 ³ ;

作者机构： 1.山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室;山东省农业科学院

2.;山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室;山东省农业科学院

3.;山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室;山东省农业科学院;

关键词： 花生;脂肪酸去饱和酶(FAD);生物信息学分析;表达模式;可变剪接

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2018 年 06 期

页码： 1-9

摘要： 脂肪酸去饱和酶(FAD)是合成不饱和脂肪酸的关键酶,在植物维持各项生命活动、应对生物与非生物胁迫方面具有重要作用。本研究对花生基因组中的FAD基因家族进行鉴定与生物信息学分析,并利用花生转录组数据对花生FAD(Ah FAD)基因的表达模式及可变剪接形式进行分析。结果显示,在花生基因组中共有31个Ah FAD基因,分为6类,Ah SAD基因亚家族有12条序列,AhFAD2有6条序列,Ah FAD3有4条序列,Ah FAD4/5有3条序列,Ah FAD6有2条序列,Ah FAD7/8有4条序列。聚类分析表明,Ah FAD有两大分支:游离Ah SAD分支和膜结合Ah FAD分支;膜结合Ah FAD分支中Ah FAD4/5起源最早,ω-3 Ah FAD由ω-6Ah FAD进化而来;单双子叶聚类于不同分支。表达模式分析表明,Ah SAD、AhFAD2和Ah FAD3在种子中表达水平较高,Ah FAD4/5、Ah FAD6、Ah FAD7/8在叶中表达量最高。可变剪接分析表明,Ah FAD亚家族之间可变剪接形式差异明显,其中有12个Ah FAD基因发生了可变剪接。TTS和TSS是发生最多的可变剪接事件,其次是IR,最少的是AE和ES。