文献类型： 中文期刊
作者： 何平 1 ; 李林光 1 ; 王海波 1 ; 李慧峰 1 ; 常源升 1 ;
作者机构： 1.山东省果树研究所
关键词： 桃;转录组;SSR;引物;多态性
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2016 年 14 卷 11 期
页码： 3130-3135
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 利用MISA软件筛选桃(Prunus persica[L.]Batsch)转录组数据,获得的109 248条Unigene,检测出24 102个SSR位点,分布于22 689条Unigene中,出现频率为20.76%。SSRs位点中主导类型是以AG/CT(占总SSRs的18.70%)为主的二核苷酸重复,占总SSRs的33%;其次是三核苷酸重复,出现频率为27%;四核苷酸重复,占总SSRs的25%。利用Primer 5共设计出9 657对SSR引物。随机选择50对引物进行PCR扩增,其中20对扩增出清晰可重复的条带,并且在同属材料(苹果试材)中也能获得理想结果,引物多态性检测发现,在15份桃试材中,10对引物具有多态性,利用UPGMA作图,可将15个桃材料很好区分。结果表明,桃转录组测序产生的Unigene是开发SSR标记的有效信息,为SSR标记在桃的遗传分析上提供可靠的标记选择。
- 相关文献
[1]基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子. 何平,李林光,王海波,常源升. 2019
[2]遮光性套袋对桃果实转录组的影响. 何平,李林光,王海波,常源升,李慧峰. 2017
[3]花生作图亲本间分子标记的多态性分析. 许梦琦,李双铃,任艳,石延茂,王辉,尹亮,袁美,刘志文. 2015
[4]利用新开发的SSR标记分析花生栽培种的多态性. 黄新阳,王传堂,杨新道,徐建芝. 2006
[5]谷子基因组SSR信息分析和标记开发. 张晗*,王雪梅*,王东建,孙加梅,杨延兵,段丽丽,李华,宋国安,王晓宇,李汝玉. 2013
[6]中国荷斯坦牛POU1F1基因与PRL基因的多态性及其聚合效应对产奶性状的影响. 贾祥捷,李秋玲,王长法,杨桂文,黄金明,仲跻峰. 2011
[7]Identification of SSR markers using soybean (Glycine max) ESTs from globular stage embryos. Li, Ai Qin,Zhao, Chuan Zhi,Wang, Xing Jun,Liu, Zhan Ji,Song, Guo Qi,Yin, Juan,Li, Chang Sheng,Xia, Han,Bi, Yu Ping,Zhang, Li Feng. 2010
[8]Study on the Genetic Diversity of Natural Chestnut Populations in Shandong China by SSR Markers. Ai Cheng-xiang,Li Guo-tian,Zhang Li-si,Liu Qing-zhong. 2009
[9]Gene identification using RNA-seq in two sweetpotato genotypes and the use of mining to analyze carotenoid biosynthesis. Qin, Z.,Li, A.,Hou, F.,Wang, Q.,Dong, S.,Zhang, L..
[10]丹参基因组SSR的开发及其多态性分析. . 2019
[11]中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因第4和第5外显子多态性与泌乳性状的关联分析. 鞠志花,王洪梅,李秋玲,黄金明,李建斌,安利国,杨桂文,仲跻峰,王长法. 2009
[12]莱芜猪DGAT1基因的多态性研究. 刘源,姜运良,武英,魏述东,杨晓慧. 2007
[13]SSR和STS标记在花生栽培品种鉴定中的应用研究. 张建成,王传堂,杨新道. 2006
[14]中国部分板栗品种的SSR标记. 艾呈祥,余贤美,张力思,刘庆忠. 2007
[15]济宁青山羊微卫星标记多态性分析. 王可,刘昭华,崔绪奎,楚惠民,张玉玉,韩红. 2017
[16]苹果α-法尼烯合酶基因组结构和序列的多态性分析. 苑克俊,刘庆忠,李勃,张力思. 2007
[17]大白菜EST-SSR标记开发中非SSR标记的鉴别. 周新成,刘立峰,李化银,高建伟. 2010
[18]荷斯坦种公牛HSF1和HSBP1基因多态性分析. 王延久,李建斌,王长法,鞠志花,黄金明,李荣岭,仲跻峰,何剑斌,李秋玲. 2011
[19]花生栽培种InDel有效标记筛选与评估. 刘宇,闫彩霞,李春娟,徐洪明,孔青,孙全喜,王娟,单世华. 2020
[20]渤海黑牛MSTN基因多态性位点与体尺性状的关联性分析. 刘桂芬,万发春,刘晓牧,谭秀文,宋恩亮. 2011
作者其他论文 更多>>
-
鲁丽/M26生长表现与栽培技术要点
作者：王涛;李晨;张勇;李慧峰
关键词：苹果;鲁丽;M26;生长表现;栽培技术
-
山东省苹果园土壤酸度与果实营养元素相关性分析
作者：王森;何平;王孝友;王海波;常源升;郑文燕;李林光;何晓文
关键词：山东;土壤酸化;苹果;营养元素
-
鲁丽苹果叶片高效不定芽再生体系的优化
作者：王娜娜;王海波;何平;常源升;王森;郑文燕;王琛;李林光;何晓文
关键词：鲁丽;苹果;不定芽;叶片极性;伤口处理
-
苹果砧木离体茎尖小滴玻璃化超低温保存体系的优化
作者：关秋竹;孙清荣;孙洪雁;王海波;李林光
关键词：苹果砧木;离体茎尖;超低温保存;小滴玻璃化
-
苹果新品种-鲁艳
作者：王海波;李林光
关键词：
-
'鲁丽'苹果低温贮藏和货架期间品质和生理变化
作者：王震;彭勇;刘静润;王昊;王海波;李林光
关键词：’鲁丽’苹果;’嘎啦’苹果;贮藏品质;生理变化;差异分析
-
中早熟苹果品种的贮藏品质和酚类物质差异分析
作者：王震;裴令栋;彭勇;李林光;王海波
关键词：‘鲁丽’苹果;贮藏品质;酚类物质;成熟度;相关性分析
