文献类型： 中文期刊

作者： 张清兰 ¹ ; 张亚冉 ² ; 鞠志花 ² ; 王秀革 ² ; 肖遥 ² ; 王金鹏 ² ; 魏晓超 ² ; 高亚平 ² ; 白福恒 ³ ; 王洪程 ¹ ;

作者机构： 1.贵州师范大学生命科学学院

2.山东省农业科学院畜牧兽医研究所山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室

3.山东鲁润畜产品有限公司

关键词： 荷斯坦奶牛;TARDBP基因;生物信息学;启动子

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 306-318

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为了解牛TARDBP基因结构、功能及启动子活性区域，分析该基因的转录调控机制。【方法】通过PCR技术克隆牛TARDBP基因编码区全长序列。应用生物信息学软件对牛TARDBP蛋白性质和结构进行分析。通过实时荧光定量PCR（RT-qPCR）技术检测TARDBP基因在泌乳期荷斯坦奶牛不同组织中的表达情况。应用5’RACE技术确定牛TARDBP基因的转录起始位点，PCR技术克隆牛TARDBP基因启动子区和5’端系列缺失片段，并运用生物信息学软件对牛TARDBP基因启动子区域CpG岛和潜在转录因子结合位点进行预测，双荧光素酶报告系统确定该基因的核心启动子区域。【结果】牛TARDBP基因在包括乳腺在内的多个组织中均有表达。TARDBP蛋白是一种水溶性非分泌蛋白，存在RNA识别结构域和DNA结合位点。TARDBP基因启动子区存在2个CpG岛和大量转录因子结合位点包括SP1、PPARA、PPARD、PPARG、SREBF1等。双荧光素酶活性分析结果显示牛TARDBP的核心启动子区位于-476--149之间，该区域包含Sp1、PPARG、PPARD、SREBF1结合元件，但不存在TATA-box。【结论】牛TARDBP基因在奶牛多个组织中均有表达。-476--149片段为牛TARDBP基因的核心启动子区，且该区域中存在与乳脂合成和分泌相关的转录因子结合位点。