您好,欢迎访问山东省农业科学院文献资源数据库平台

大豆响应涝害bZIP基因Glyma04g04170的生物信息学分析及互作蛋白预测

文献类型: 中文期刊

作者: 林延慧 1 ; 唐力琼 1 ; 徐靖 1 ; 朱红林 1 ; 王新华 1 ; 王敏芬 1 ; 徐冉 2 ; 王效宁 1 ;

作者机构: 1.海南省农业科学院粮食作物研究所/海南省农作物遗传育种重点实验室/农业部作物基因资源与种质创制海南科学观测实验站

2.山东省农业科学院作物研究所

关键词: 大豆;耐涝;转录组;bZIP转录因子

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2020 年 005 期

页码: 727-733

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: bZIP转录因子参与多种非生物胁迫,为研究涝害胁迫下大豆bZIP转录因子的调控作用,本研究对耐涝性极强大豆品种齐黄34进行淹水处理,对处理不同时间根部组织样品进行转录组测序,筛选出1个响应耐涝的差异表达的bZIP转录因子编码基因Glyma04g04170,其qRT-PCR分析结果与转录组测序数据趋势一致,在4个取样时间点都下调表达,证明该转录组数据具有可靠性,Glyma04g04170可能通过负调控的方式参与大豆耐涝应答反应.Glyma04g04170蛋白保守结构域分析发现该蛋白内部含有bZIP保守结构域.蛋白三级结构中存在参与寡聚化作用的亮氨酸拉链保守结构域,同时也包含与特异DNA序列相结合、起核定位信号作用的N-x7-R/K结构.分离鉴定的Glyma04g04170蛋白是一个结合AREB/ABF的bZIP转录因子,预测结果显示,与该蛋白互作的蛋白主要是丝氨酸/苏氨酸残基蛋白磷酸酶.转录组和RT-qPCR数据表明,Glyma02g37090基因在4个取样时间点的表达量都呈显著性差异,处理与对照相比,表达量升高.

  • 相关文献

[1]基于大豆叶枕响应叶柄角变化转录组的MYB基因分析. 常玮,王娟,郑清岭,张彦威,陈吉宝. 2024

[2]耐涝高产大花生品种花育9306的选育. 闫彩霞,李春娟,赵小波,王娟,孙全喜,苑翠玲,张浩,单世华. 2021

[3]苹果光响应转录因子MdHY5表达及蛋白互作分析. 李慧峰,王小非,冉昆,何平,王海波,李林光. 2014

[4]桃(Prunus persica [L.] Batsch)转录组SSR信息分析及其分子标记开发. 何平,李林光,王海波,李慧峰,常源升. 2016

[5]干旱胁迫下谷子的转录组分析. 王庆国,李臻,管延安,刘炜,潘教文. 2018

[6]苹果矮化砧‘71-3-150’对冷胁迫的生理与转录组响应. 王海波,程来亮,常源升,孙清荣,陶吉寒,李林光. 2016

[7]基于高通量测序的菟丝子生防菌"鲁保一号"转录组学研究. 李健,李美,高兴祥,房锋. 2021

[8]氮素缓解花生干旱胁迫的生理和转录调控机制. 丁红,张智猛,徐扬,张冠初,郭庆,秦斐斐,戴良香. 2023

[9]苹果矮化砧'71-3-150'对冷胁迫的生理与转录组响应. 王海波,程来亮,常源升,孙清荣,陶吉寒,李林光. 2016

[10]基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子. 何平,李林光,王海波,常源升. 2019

[11]盐胁迫条件下花生转录因子表达分析. 赵小波,闫彩霞,李春娟,王娟,姜常松,单世华. 2017

[12]NaCl处理谷子萌发期种子的转录组学分析. 潘教文,李臻,王庆国,管延安,李小波,戴绍军,丁国华,刘炜. 2019

[13]基于转录组测序解析草地贪夜蛾对溴氰虫酰胺的解毒代谢分子机制. 杨媛雪,王爱玉,张芸,张开军,薛超,刘怀,赵鸣,张建华. 2023

[14]猕猴桃'脐红'与'徐香'越冬期转录组的比较分析. 毛可欣,王海荣,安淼,吕巍,李健,李国田. 2023

[15]苹果果实可溶性固形物含量相关基因的全基因组筛选与分析. 苑克俊,程来亮,牛庆霖,王江勇. 2016

[16]遮光性套袋对桃果实转录组的影响. 何平,李林光,王海波,常源升,李慧峰. 2017

[17]花生中三个LEA基因的克隆与表达分析. 赵小波,张廷婷,闫彩霞,李春娟,王娟,张浩,石程仁,单世华. 2016

[18]基于RNA-Seq鉴定不同石榴品种间果实糖酸代谢基因. 冯立娟,付莹,王传增,杨雪梅,尹燕雷,陶吉寒. 2022

[19]除草剂土壤处理防除大豆田杂草技术研究. 于建垒,宋国春,李美,赵德友,林相璀. 2001

[20]硒对干旱胁迫下大豆幼苗中膜脂过氧化的影响. 刘元英,罗盛国,李彦,姜伯文,赵久明. 1999

作者其他论文 更多>>