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谷子NCED3基因克隆及生物信息学和表达模式分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王艳珂 1 ; 黎飞飞 2 ; 陈二影 2 ; 杨延兵 2 ; 管延安 2 ; 高文伟 1 ; 秦岭 2 ;

作者机构： 1.新疆农业大学农学院

2.山东省农业科学院作物研究所

关键词： 谷子;SiNCED3;基因克隆;生物信息学分析;表达分析

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2022 年 54 卷 009 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心

摘要： 脱落酸(ABA)在植物生长发育中起着重要作用,9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)是ABA合成过程中的关键限速酶,关于谷子(Setaria italica)NCED基因研究的报道较少.本研究以济谷22为材料,通过RT-PCR克隆得到SiNCED3,生物信息学分析结果表明,其cDNA全长1836 bp,编码611个氨基酸;SiNCED3蛋白相对分子质量为66.36 kD,等电点为6.15,为稳定蛋白,无信号肽,亚细胞定位预测定位于叶绿体中,含一个NCED基因家族典型结构域RPE65,二级结构主要由无规则卷曲和延伸链构成;启动子顺式作用元件分析表明其受光、ABA、生长素等调控.通过qRT-PCR发现,SiNCED3在谷子根、茎、叶、叶鞘、穗等组织中均有表达,根中的表达量最高;干旱、低温以及盐胁迫都可以不同程度地诱导SiNCED3在谷子幼苗中的表达,表明该基因可能参与调控谷子对不同逆境的响应.

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