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大白菜LEAFY新基因BrLFY1的生物信息学解析

文献类型： 中文期刊

作者： 李利斌 1 ; 李化银 1 ; 刘国明 2 ; 刘立锋 1 ; 高建伟 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院蔬菜研究所

2.寿光市台头镇农业技术综合服务站

关键词： 大白菜;LEAFY;结构分析;顺式元件;遗传进化

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2009 年 10 期

页码： 11-14

摘要： 利用比较基因组学的方法从大白菜基因组序列中鉴定出一个新的LEAFY基因BrLFY1,并对它的序列特征、遗传进化和顺式元件进行了分析。结果表明,BrLFY1含有两个内含子,预测编码区为1260 bp,编码一个分子量为46.38 ku的蛋白。在进化上,BrLFY1与萝卜的RsLFY1关系最近,二者预测编码蛋白的序列一致性高达94.79%。另外,在BrLFY1的上游序列中存在多个激素和逆境应答元件。这说明大白菜LEAFY基因BrLFY1的表达可能不仅受多种激素的调节,还受多种逆境因子的影响。本研究为进一步研究BrLFY1在大白菜开花和逆境响应中的功能奠定了基础。

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