您好，欢迎访问山东省农业科学院文献资源数据库平台

日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育

文献类型： 中文期刊

作者： 申欣 1 ; 李晓 2 ; 沙忠利 2 ; 阎斌伦 2 ; 徐启华 2 ;

作者机构： 1.淮海工学院

2.淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室;中国科学院海洋研究所;山东省花生研究所

关键词： 十足目;真虾下目;线粒体基因组;基因排列;系统发育

期刊名称： 中国科学:生命科学

ISSN： 1674-7232

年卷期： 2012 年 07 期

页码： 83-90

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 在日本鼓虾线粒体基因组完成的基础上,结合现有线粒体基因组数据,全面揭示了真虾类线粒体基因组的基本特征.日本鼓虾线粒体基因组全长16487bp,包含37个基因,与后生动物线粒体基因组的标准基因组成一致.4个已完成的真虾类(罗氏沼虾、日本沼虾、沼虾Macrobrachium lanchesteri和夏威夷红虾)线粒体基因组的基因排列与泛甲壳动物的原始排列完全相同,过去曾经认为在真虾下目线粒体基因组中没有基因重排现象.然而,鼓虾线粒体基因组中存在1个转运RNA基因(trnE)的易位和反转,这种基因排列方式在其他甲壳动物线粒体基因组中未见报道.同时,脊尾白虾线粒体基因组中存在1个转运RNA基因(trnP或trnT)的易位.分别统计了2种鼓虾(日本鼓虾和鲜明鼓虾)和3种沼虾(罗氏沼虾、日本沼虾和沼虾M.lanchesteri)13个蛋白质编码基因(PCGs)非同义替换与同义替换的比值(Ka/Ks),发现鼓虾和沼虾所有线粒体蛋白质编码基因的Ka/Ks均小于1,显示出强烈的纯化选择.基于线粒体基因组的系统发育分析结果,强烈支持长臂虾科和鼓虾科为单系群,并且其在科级的亲缘关系为:(长臂虾科+鼓虾科)+匙指虾科(BPM=100,BPP=100).

  • 相关文献

[1]日本鼓虾与鲜明鼓虾线粒体基因组全序列的分析比较. 申欣,李晓,徐启华. 2012

[2]山东PRRSV流行株ORF5、ORF6、ORF7基因序列的遗传演化和系统发育关系. 李俊,徐绍建,时建立,吴家强,温建新,王金宝. 2008

[3]不同禽源副粘病毒分离株HN基因的克隆与序列分析. 王旋,黄兵,张训海,于可响,钟登科,宋敏训,龚争,赵磊. 2010

[4]茄腐镰孢(Fusarium solani)线粒体基因组密码子偏好性分析. 李秀璋,宋辉,李春杰. 2015

[5]德州驴完整线粒体基因组特点及进化分析. SUN Yan,孙艳,JIANG Qiang,姜强,JV Zhi-hua. 2015

[6]基于线粒体COI基因序列的挂墩稻弄蝶分类地位研究. 国栋,范骁凌,王敏. 2010

[7]印度块菌在我国东北地区的分布及其生态学意义. 李佳梅,刘培贵,乔鹏,唐燕静,李杨,陈娟,郭顺星. 2019

[8]铜绿丽金龟线粒体全基因组及其系统发育分析. 曲春娟,朱悦,江晨,曲明静,王向誉,李晓. 2023

[9]野生花生全基因组抗病相关LOX基因的生物信息学分析. 宋辉,赵术珍,侯蕾,乔善良,赵传志,李爱芹,王兴军. 2015

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：山东省农业科学院文献资源数据库平台

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台