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桃NHX基因家族的全基因组鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李淼 1 ; 李桂祥 1 ; 刘伟 1 ; 高晓兰 1 ; 王孝友 2 ; 张安宁 1 ;

作者机构： 1.山东省果树研究所

2.蒙阴县果业发展服务中心

关键词： 桃;NHX基因家族;全基因组;基因表达

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2021 年 012 期

页码： 8-16

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究利用生物信息学方法从桃全基因组数据库筛选出7个NHX反向转运体,并对其序列特征、基因结构、进化关系、亚细胞定位、组织表达谱和盐胁迫响应性进行综合分析。结果表明,7个桃NHX具有清晰的亲缘远近关系;5个桃NHX（NHX1,NHX4～NHX7）基因在结构等方面具有相似性,亲缘关系较近,而与NHX2和NHX3亲缘关系较远。7个桃NHX蛋白在N端具有明显的跨膜结构区域。顺式元件分析表明,桃NHX基因家族上游启动子区域包含与光信号、激素、逆境胁迫及分生组织表达相关的顺式作用元件。qRT-PCR分析结果显示,大多数桃NHX家族成员在茎中表达较多;所有桃NHX成员对外源盐处理具有响应性。

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