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向日葵抗坏血酸过氧化物酶的电子克隆和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孟鹏 1 ; 李根英 2 ; 陈国强 3 ; 王振东 1 ;

作者机构： 1.沈阳农业大学生物科学技术学院

2.山东省农业科学院作物研究所

3.淮海工学院/江苏省海洋生物技术重点实验室

关键词： 向日葵;抗坏血酸过氧化物酶;电子克隆;生物信息学

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2012 年 44 卷 06 期

页码： 1-6

摘要： 利用电子克隆技术得到长753 bp的向日葵抗坏血酸过氧化物酶(HaAPX)cDNA。通过生物信息学分析发现,HaAPX在核酸水平和蛋白质水平上都与常见物种的APX非常相似,具有极其保守的酶活作用域Peroxidase-1(-divtlsggHtl-)和Peroxidase-2(-aplmlRlawHsa-),且配体结合位点和金属结合位点完全保守。HaAPX与甘薯(Ipomoea batatas)APX亲缘关系很近,其编码蛋白由250个氨基酸组成,分子量为2.7 ku,无信号肽和跨膜区,二级结构由37.6%α-螺旋、13.2%β-折叠、9.2%β-转角和40%无规则卷曲组成,三维构象与豌豆APX的非常相似。

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