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陆地棉L-D1等位基因特异性分子标记的开发及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 姜辉 1 ; 郑锦秀 2 ; 王永翠 1 ; 张超 1 ; 王秀丽 1 ; 陈莹 1 ; 高明伟 1 ; 王家宝 1 ; 柴启超 1 ; 赵军胜 1 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院经济作物研究所

2.汶上县第一中学

关键词: 冠层改良;叶形;L-D1位点;特异分子标记;陆地棉

期刊名称: 棉花学报

ISSN: 1002-7807

年卷期: 2021 年 005 期

页码: 412-421

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】L-D1基因调控陆地棉叶形。本研究设计特异分子标记精准鉴定L-D1等位基因,为其在陆地棉冠层结构改良中的应用提供支撑。【方法】利用具有鲁棉研28号遗传背景的L-D1等位基因近等基因系,分析不同等位基因组合对叶形的影响。根据4个等位基因的启动子和编码区的多态性设计特异分子标记,并对不同叶形中的等位基因进行检测。【结果】L-D1基因从3叶期开始调控叶片叶裂的形成,4~8叶期叶裂不断加深,从9叶期开始基本稳定;L-D1等位基因不同组合可形成相似叶形,仅从形态上难以准确辨别。克隆获得L-D1位点4个等位基因起始密码子前约4 kb的启动子片段,发现24个SNPs(Single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性)、1个133 bp及1个14 bp的插入缺失。根据等位基因启动子及编码区的SNP和缺失插入开发了1个Indel分子标记InDel_8和2个衍生酶切扩增多态性序列标记dCAPS_192、dCAPS_519,分别为l2、L2o、L2s的特异分子标记。【结论】根据陆地棉中控制叶形的L-D1等位基因间的差异开发了3个特异性分子标记,可用来鉴定不同的L-D1等位基因。

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