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石榴查尔酮合成酶蛋白的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 冯立娟 1 ; 尹燕雷 1 ; 杨雪梅 1 ; 唐海霞 1 ; 李英朋 1 ; 鹿英 1 ;

作者机构： 1.山东省果树研究所;冠县店子乡林业站;肥城市石横镇林果站

关键词： 石榴;花青苷;查尔酮合成酶;生物信息学

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2019 年 02 期

页码： 7-12

摘要： 本研究用生物信息学方法对石榴及其他19个物种CHS蛋白的系统进化和motif元件进行分析,重点预测分析石榴、巨桉和拟南芥CHS蛋白的理化性质、氨基酸组成、磷酸化位点和二级结构。结果表明,石榴与巨桉亲缘关系最近,与拟南芥最远。石榴、巨桉和拟南芥CHS蛋白由20种氨基酸组成,数量和比例存在差异,石榴和拟南芥中亮氨酸数量最多,巨桉中丙氨酸最多;存在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸3个磷酸化结合位点,多数发生在苏氨酸和丝氨酸位置上;二级结构由α-螺旋、延伸链、无规则卷曲和β-转角构成,α-螺旋和无规则卷曲占比较高。在20个物种CHS蛋白的motif元件中,石榴CHS蛋白motif数量和位置与巨桉完全一致,与大多数物种相似,与拟南芥差异较大。本研究结果可为深入研究CHS生物学功能及其调控石榴果实呈色的机理提供理论依据。

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