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花生栽培种InDel有效标记筛选与评估

文献类型： 中文期刊

作者： 刘宇 1 ; 闫彩霞 1 ; 李春娟 1 ; 徐洪明 1 ; 孔青 1 ; 孙全喜 1 ; 王娟 1 ; 单世华 1 ;

作者机构： 1.山东省花生研究所;中国海洋大学食品科学与工程学院;东阿县农业技术推广站

关键词： 花生;InDeI标记;多态性

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 256-264

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为获得花生栽培种中有效的InDel标记,本研究基于花生简化基因组检测到的InDel信息,经PCR扩增以及电泳检测验证引物的有效性与多态性,利用生物统计学软件检测InDel标记的多态性水平。结果表明,在花生基因组上设计的39对引物在覆盖4个植物学类型的21份花生中均可获得扩增产物,其中14对引物具有多态性,为总引物数的35.9%,有3对引物位于基因编码区;Shannon指数为0.191 4～1.295 1,均值为0.579 4;多态性信息量(PIC)为0.090 7～0.674 6,均值为0.349 6。本研究筛选获得的InDeI标记可为花生栽培种遗传图谱构建和分子标记辅助育种提供有效的遗传标记。

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