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花生HSP 20基因家族鉴定及其表达特性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 姜焕焕 1 ; 张嘉敏 1 ; 何洪活 1 ; 李丽梅 1 ; 吴倩盈 1 ; 黄晓 1 ; 王通 1 ;

作者机构： 1.肇庆学院生命科学学院;山东省花生研究所

关键词： 花生;HSP 20基因家族;生物信息学;表达特性

期刊名称： 肇庆学院学报

ISSN： 1009-8445

年卷期： 2022 年 05 期

页码： 6-14

摘要： HSP20是一类小分子热激蛋白，在植物抵御逆境胁迫中发挥重要作用.本研究借助花生基因组数据库，通过隐马尔可夫（Hiddne Markov Model,HMM）搜索野生种花生（Arachis duranensis）和（Arachis ipaensis）蛋白质数据库，鉴定出AdHSP 20和AiHSP 20基因各27个，基因长度为946～1 103 bp，不均匀分布在花生9条染色体上.进化树分析显示，这些基因分为11个亚家族.通过对基因结构和保守序列分析表明该基因家族高度保守.表达分析发现，2个野生种花生中各有5个基因在各组织中高表达，大部分基因在果针入土期开始大量表达，具有组织表达特异性，存在多个激素及逆境胁迫相关的顺式作用元件，预示着该基因家族参与花生逆境胁迫响应.

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