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谷子胁迫诱导型启动子SiRLK35P的分离及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王一帆 1 ; 潘教文 2 ; 李臻 2 ; 王庆国 2 ; 李颖秀 2 ; 管延安 2 ; 刘炜 3 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生理生态重点实验室;青岛农业大学生命科学学院;山东省农业科学院作物研究所

2.;山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生理生态重点实验室;青岛农业大学生命科学学院;山东省农业科学院作物研究所

3.;山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生理生态重点实验室;青岛农业大学生命科学学院;山东省农业科学院作物研究所;

关键词: 谷子;启动子;SiRLK35P;顺式作用元件;抗逆;品种培育

期刊名称: 山东农业科学

ISSN: 1001-4942

年卷期: 2017 年 07 期

页码: 7-11

摘要: 本研究以谷子"豫谷1号"为材料,结合相关数据库检索,以谷子幼苗提取的基因组DNA为模板,经PCR特异扩增SiRLK35上游1 893 bp调控序列,命名为SiRLK35P。结合PLACE数据库,对SiRLK35P进行生物信息学分析,并对其诱导表达情况进行了预测。结果显示,SiRLK35P中含有ABRELATERD1(ACGT)、GCCCORE(GCCGCC)等多种顺式作用元件,部分元件已知与不同逆境胁迫及应答相关,预测该启动子可能参与谷子胁迫响应,调控下游基因在胁迫等逆境条件下的表达水平,从而对谷子在胁迫下的应答进行调控。该研究为定向改良谷子抗逆特性、培育谷子抗逆新品种提供了候选材料。

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