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资源类型: 中文期刊
关键词:RTPCR(模糊匹配)
共45条记录
鸡传染性支气管炎山东A株病毒S_1高可变区基因的克隆

《中国预防兽医学报 》 2003 北大核心 CSCD

摘要:参照国外已发表的M41高可变区S1序列设计一对引物 ,跨度为 1 .7kb左右。采用差速离心法浓缩病毒 ,提取病毒RNA ,经RT_PCR扩增 ,得到与设计同样大小的PCRDNA片段 ,将PCR产物纯化 ,与质粒载体 (pGEM_TEasyVector)连接 ,并转入大肠杆菌JM1 0 9,获取阳性克隆。增菌培养后用小量碱提取法提取质粒 ,利用PCR扩增法与EcoRI酶切分析进行鉴定。对阳性质粒DNA进行测序 ,利用Omiga2 .0、Dnasis等分子生物学软件进行分析 ,并与标准M41株、T株等进行序列比较 ,结果表明 :山东传支A株与标准M41株同源性较高 ,最大同源率为 99% ;与标准T株同源性较差 ,最大同源率为 80 %。理论酶切图谱与M41相同 ,为同一基因型。

关键词: IBV-A RT-PCR S1基因克隆

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甜瓜果实酸性转化酶基因cDNA片段的克隆

《园艺学报 》 2003 北大核心 CSCD

摘要:根据在GenBank中登录的番茄、胡萝卜和柑桔等酸性转化酶基因的保守序列设计引物 ,采用RT -PCR方法 ,从甜瓜果实总RNA中扩增出目标cDNA片段 ,克隆到pMD18 T载体中。序列分析表明 ,它与其它植物的酸性转化酶基因的同源性很高 ,与番茄氨基酸序列同源性为 99%,说明已经成功克隆到甜瓜果实酸性转化酶基因cDNA片段 ,在GenBank中登记号AF490 42 5。

关键词: 甜瓜 果实 RT-PCR 酸性转化酶基因

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马铃薯Y病毒外壳蛋白基因的克隆及全序列测定

《中国马铃薯 》 2003

摘要:自田间采集的马铃薯病叶中提取马铃薯Y病毒 (PVY)总RNA ,人工合成引物P1、P2 ,通过RT PCR扩增合成PVY cp的cDNA ,并将其克隆到 pGEM TEasy载体上。经限制酶谱分析后进行全序列测定 ,结果表明 :该基因由 80 1个核苷酸组成 ,编码 2 67个氨基酸 ,与文献报道的 3个PVY cp基因相比同源性均在 90 %以上 ,且其编码的氨基酸同源性均在 94 4 %以上。说明PVY cp基因具有较高的保守性

关键词: 马铃薯Y病毒 外壳蛋白基因 RT-PCR 序列分析

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马铃薯X病毒外壳蛋白基因的克隆及其原核表达载体的构建

《中国马铃薯 》 2002

摘要:将来源于国际马铃薯中心 (InternationalPotatoCenter ,ClP)PVX病毒毒源接种至烟草上 ,对表现明显症状的烟草叶片提取马铃薯病毒X (PVX)总RNA ,人工合成引物P1、P2 ,通过RT PCR扩增合成PVX cp的cDNA ,井将其克隆到pGEM T载体上。经限制酶谱分析后进行全序列测定 ,结果表明 :该基因由 714个核苷酸组成 ,编码 2 38个氨基酸 ,与文献 (分别来源于亚洲、非洲和欧洲 )报道的 4个 pVX cp基因相比同源性为 81%~ 95 % ,其编码的氨基酸同源性均在 90 %以上。说明PVX cp具有较高的保守性。用内切酶将PVX cp基因自克隆载体 pGEM切下 ,定向插入到表达质粒 pBV2 2 0的启动子Pr、Pl的下游 ,构建了该基因的原核表达载体pBV pvx ,为进行该基因的原核表达和抗血清的制备奠定了基础。

关键词: 马铃薯X病毒 外壳蛋白基因 RT-PCR 序列分析

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传染性支气管炎病毒山东及北京分离株血清型及RFLP基因分型的比较研究

《中国兽医杂志 》 2002 北大核心

摘要:分离并鉴定出山东省不同地区的 IBV分离株 A、B、C、D和北京分离株 F,利用中和试验分别对各分离株及标准株M4 1 、T等进行血清分型。设计一对引物 ,分别对各毒株的 S1 基因进行 RT- PCR扩增 ,扩增片段长约 170 0 bp,利用其 PCR产物进行 Hae 酶切 ,根据酶切图谱 ,进行基因分型。结果表明 :A、C、D和 M4 1 酶切图谱相同 ,属 Mass基因型 ,分别为 90 0、4 0 0和30 0 bp左右的片段 ;北京 F株有 4条酶切条带 ,与 4 /91基因型不同 ,分别为 10 0 0、30 0、2 0 0和小于 10 0 bp左右的片段 ;B株有4条酶切条带 ,理论推断与 T株相似 ,分别为 70 0、5 0 0、30 0和 180 bp左右的片段 ,可能为同一基因型。血清学分型结果与基因分型结果不符。

关键词: 传染性支气管炎病毒 血清型 RT-PCR RFLP 基因型

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