科研产出
生物信息学预测植物miRNAs的方法
《植物遗传资源学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：MicroRNA又称miRNA,是一类广泛存在于动植物体内、大小为21~25nt左右的内源性非编码单链小分子RNA。在植物体中,miRNA主要负责调控转录后基因的表达,在机体发育、生长和应答胁迫方面发挥着重要的调节作用。近年来,miRNA已成为分子生物学领域的研究热点。本文介绍了几种发现和研究miRNA的方法,重点阐述了生物信息学预测miRNA方法的流程和策略,并对各过程中采用的方法及信息学软件的优劣性进行比较和分析,为预测miRNA提供新的思路。
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应用遥感时序数据研究植被变化与气候因子的关系——以环渤海地区为例
《国土资源遥感 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：在全球气候变化背景下研究陆地植被的时空变化规律,探讨气候因素的驱动作用,对于预测未来气候变化对生态系统的可能影响、制定合适的生态环境保护策略具有重要意义。利用2000—2009年MODIS归一化差值植被指数(normalized difference vegetation index,NDVI)时间序列数据和地面气象站点的气温、降水量数据,从遥感角度分析环渤海地区植被的时空变化,并研究变化与气温、降水的相关关系,探讨区域植被年内和年际变化的驱动因素。结果表明,2000—2009年环渤海地区植被覆盖总体呈增加的趋势,但存在一定的空间异质性,局部有减少的倾向;区域植被的生长受温度和降水的双重驱动,对降水和温度的响应存在明显的滞后,滞后期大约为1个合成期;年际的变化主要受降水和人类活动的影响,降水增加可使区域NDVI提高;不同的人类活动会导致NDVI向相反的方向发展。
关键词： 植被 MODIS NDVI 气温 降水 环渤海地区
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MYB转录因子在植物盐胁迫调控中的研究进展
《植物生理学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：盐胁迫是影响植物生长、发育及作物产量的重要环境因子。在植物响应高盐胁迫的过程中,许多基因被激活,并产生了许多抵御盐胁迫的蛋白。这些胁迫诱导基因的表达大多由转录因子调控。MYB转录因子广泛存在于真核生物中,是一类数量较多、功能多样的转录因子家族。MYB蛋白在包括盐胁迫在内的植物非生物胁迫调控中有重要作用。MYB转录因子在结构上具有多样性,因此对植物盐胁迫的调控机制较为复杂。近年来,随着研究手段的提高,MYB家族转录因子,尤其是R2R3-MYB,在盐胁迫调控中的作用机制得到了较为深入的研究。此外,越来越多的MYB-related蛋白也被证实参与了植物盐胁迫的调控。本文论述了MYB转录因子的结构特征和不同类型MYB蛋白在盐胁迫调控中的功能及作用机制,以期为MYB转录因子的研究和利用提供参考。
植物法呢基焦磷酸合酶基因(FPPS)研究进展
《农业生物技术学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：植物法呢基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase,FPPS)是甲羟戊酸代谢途径分支点的关键酶,参与叶绿素、类胡萝卜素、细胞分裂素、脱落酸、赤霉素、长萜醇、类萜、辅酶Q、甾醇和植物毒素等类异戊二烯物质的合成,而类异戊二烯是维持植物生长发育等所必需的重要有机物质。本文综述了植物法呢基焦磷酸合酶基因克隆、基因表达、酶动力学研究等方面的重要进展,旨在为其在植物进化分类、遗传改良中的应用提供参考。
关键词： 植物 类异戊二烯 法呢基焦磷酸合酶(FPPS) 基因克隆 基因表达
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基于Internet的山东省作物种质资源共享平台的开发与研究
《山东农业科学 》 2011
摘要：针对山东省作物种质资源保存分散、标准不同和共享困难等问题,在成功开发单机版山东省作物种质资源数据库管理系统的基础上,采用B/S设计模式和J2EE系统架构,用Java 1.5语言设计开发了基于Internet的山东省作物种质资源共享平台。后台采用SQL Server2000数据库,平台设计开发充分利用了先进的框架技术如struts和hibernate,使系统各层之间结构更加合理,独立性更强,实现了页面展现层、业务逻辑层、持久化层和数据层4层分离的体系结构,很好地提高了种质资源共享平台的可移植性、可维护性和可扩展性。平台的建立与运行为山东省作物种质资源收集保存、鉴定评价、标准化整理、数字化表达和利用提供了一个与国家种质资源库和互联网对接的作物种质资源数据管理与信息发布系统,实现了真正意义上的作物种质资源数据共享,为社会各界相关工作者提供了更加全面的种质资源信息。
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