科研产出
盐胁迫条件下花生应答转录因子鉴定与分析
《山东农业科学 》 2018
摘要：转录因子是一类具有特殊结构、调控基因表达的蛋白质分子。为了解析转录因子在花生适应盐胁迫环境中的分子机制,本研究以鲁花14号为材料,通过RNA-seq分析花生转录因子在盐胁迫以及恢复后的表达差异。结果表明,在250 mmol/L Na Cl处理4 d后,花生中共检测到76个差异表达的转录因子,分别属于13个转录因子家族。其中,根中35个转录因子上调表达,29个下调表达;地上部40个上调表达,17个下调表达。盐胁迫解除后,有35个转录因子不但没有恢复到盐处理前的水平,反而表达量进一步增加。本试验为进一步研究花生转录因子家族在盐胁迫中的作用和提高花生的耐盐性奠定理论基础。
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苹果抗寒矮化砧应答冷胁迫的转录因子基因鉴定
《植物生理学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：利用RNA-seq鉴定抗寒苹果矮化砧木‘71-3-150’冷胁迫(4°C)响应过程中的转录因子。结果表明:该砧木冷胁迫2、6、12和24 h时的样品与未处理相比,差异表达的转录因子基因数分别为83、98、115和136,共计228个,表明大量转录因子参与该砧木的冷胁迫响应。这些转录因子基因属于32个家族,占苹果转录因子总数的7.25%,包括32个WRKY、30个AP2/ERF、28个b HLH、21个MYB、13个NAC、12个HSF、10个CO-like、9个MYB_related、8个TCP、6个b ZIP、6个C2H2、6个C3H、6个GATA、5个G2-like、4个GRAS、4个HD-ZIP、4个NF-YC、4个ARF、3个Dof、3个Trihelix、2个GRF和2个NF-YB,以及B3、DBB、E2F/DP、EIL、MIKC、M-type、SBP、TALE、YABBY和ZF-HD家族的各1个成员,其中有8个在苹果参考基因组没有注释。这些基因总体上分为10类表达模式,同一类表达模式中的基因均涉及到多个转录因子家族,表明转录调控在该砧木应答冷胁迫中存在复杂机制。根据对鉴定到转录因子基因的功能分析,它们参与了冷适应相关功能基因和生长发育相关功能基因的表达调控,使该砧木在冷胁迫下重建体内物质代谢和氧化还原平衡,获得抗寒性,并且重建适应冷胁迫的新的生长与发育平衡。
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花生中低温胁迫相关转录因子基因的筛选
《核农学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为了研究花生低温胁迫下的基因表达调控机理,以花生花育19为材料,通过低温处理后芯片杂交实验,筛选花生叶片中低温胁迫响应转录因子基因。结果表明,175个具有转录调控活性的基因在低温胁迫的花生叶片中表达变化量达到2倍以上,其中92个为上调基因,83个为下调基因。通过基因功能分类分析发现,这些基因中53个上调基因和46个下调基因编码转录因子。进一步分析发现,参与花生低温抗性调控的转录因子主要包括MYB、WRKY、NAC及AP2/ERF等家族蛋白。此外,一些不包含已知保守结构域的转录因子也参与了花生低温抗性调控。本研究为花生低温抗性调控研究提供了新的转录因子基因资源。
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‘鲁星’桃中10个MADS-box基因克隆和表达分析
《中国农业科学 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：【目的】克隆‘鲁星’桃(Prunus persica var.nectarina‘Luxing’)中参与调控营养和生殖生长的MADS-box(Pp MADS)基因,研究其在不同组织器官中的表达特性,为解析该基因在花发育和果实发育及成熟过程中的功能奠定基础。【方法】利用同源比对和RT-PCR技术,克隆获得‘鲁星’桃中10个Pp MADS全长c DNA序列,并进行生物信息学相关分析;采用RT-PCR技术检测PpMADSs在茎、叶、萼片、子房、雄蕊、花瓣等组织以及花发育7个阶段和果实发育5个阶段的表达特性。【结果】测序结果显示,获得10个PpMADSs(Pp MADS11、12、19、20、21、22、28、29、30和31;Gen Bank登录号分别为KU559577、KU559578、KU559585、KU559586、KU559587、KU559588、KU559594、KU559595、KU559596和KU559597),其开放阅读框(open reading frame,ORF)分别为522、279、1 065、828、723、600、636、534、750和480 bp。进化分析表明,PpMADS11属于AP3亚组,PpMADS12是AGL17亚组,Pp MADS19属于MIKC*组,Pp MADS20、21和22同被分为Mα组,PpMADS28、29、30和31同属于Mγ组。亚细胞定位预测结果显示,10个PpMADS蛋白均定位于细胞核中。启动子分析显示,PpMADSs启动子区域含有多个顺式作用元件,包括光响应元件、防御及逆境响应元件、干旱诱导的MYB结合位点、热激响应元件、低温响应元件、真菌效应子响应元件、伤害响应元件、厌氧响应元件、GA响应元件、Auxin响应元件、Me JA响应元件、ABA响应元件、SA响应元件和乙烯响应元件。半定量RT-PCR和q RT-PCR结果显示,PpMADS11在茎、叶、萼片、子房、雄蕊、花瓣、花发育和果实发育中表达;PpMADS12在茎、叶、萼片、子房、雄蕊、花瓣和花发育中表达;Pp MADS19在萼片、雄蕊、花瓣和花发育中(苗期除外)表达;Mα组和Mγ组所有成员在茎、叶、萼片、子房、雄蕊、花瓣和花发育中均有表达,部分成员在果实发育中表达。【结论】10个PpMADS在‘鲁星’桃的营养生长以及花和果实发育过程中可能具有重要的调控作用。
关键词： ‘鲁星’桃 MADS-box 转录因子 基因克隆 表达分析
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花生中低温胁迫相关转录因子基因的筛选
《核农学报 》 2015 CSCD
摘要：为了研究花生低温胁迫下的基因表达调控机理,以花生花育19为材料,通过低温处理后芯片杂交实验,筛选花生叶片中低温胁迫响应转录因子基因。结果表明,175个具有转录调控活性的基因在低温胁迫的花生叶片中表达变化量达到2倍以上,其中92个为上调基因,83个为下调基因。通过基因功能分类分析发现,这些基因中53个上调基因和46个下调基因编码转录因子。进一步分析发现,参与花生低温抗性调控的转录因子主要包括MYB、WRKY、NAC及AP2/ERF等家族蛋白。此外,一些不包含已知保守结构域的转录因子也参与了花生低温抗性调控。本研究为花生低温抗性调控研究提供了新的转录因子基因资源。
绒毛白蜡2个MYB转录因子的活性鉴定及其表达分析
《江西农业大学学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：绒毛白蜡(Fraxinus velutina Torr.)FvMYB1和FvMYB2基因分别属于R1-MYB和R2R3-MYB转录因子家族成员。通过酵母(Saccharomyces cerevisiae)单杂交系统分别对其转录活性进行了鉴定,并分析了2个基因在不同组织中的表达模式。酵母滤纸显色反应结果表明两个转录因子均能激活下游报告基因(His和LacZ)的表达,具有转录激活功能;β–半乳糖苷酶活性检测法定量分析得出FvMYB1和FvMYB2的半乳糖苷酶活性分别为14.55 U和20.80 U。组织特异性分析显示,两者在各组织(根、子叶、茎、叶)中均有表达,但各自又表现出不同的组织表达差异,其中FvMYB1基因在茎中表达量最高,根中最低;而FvMYB2基因在各组织中的表达量无明显差异。
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植物SPL转录因子研究进展
《植物学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：SPL(SQUAMOSA promoter-binding protein-like)是一类植物特有的转录因子,在调控植物胚胎发育、间隔期长度、叶片发育、发育阶段转变、花和果实发育、育性、顶端优势、花青素积累、赤霉素响应、光信号转导及体内铜离子稳态平衡等方面发挥重要作用。SPL含有一个由80个氨基酸残基组成的高度保守的SBP结构域,以此同下游靶基因启动子区域结合,调控靶基因的表达。大多数SPL均具有miR156/157识别位点,miR156/157可以通过mRNA剪切或翻译抑制来调控SPL的表达。该文重点综述了植物SPL基因的结构、表达调控及生物学功能,并对其研究前景进行了展望。
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利用基因工程改良植物脂肪酸和提高植物含油量的研究进展
《生物工程学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：植物脂肪酸和三酰甘油具有重要生理功能以及巨大的食用和工业价值,其生物合成途径较为复杂。近年来,植物脂肪酸和三酰甘油合成代谢途径的研究取得了很大进展,在多种植物中克隆了脂肪酸和三酰甘油合成代谢途径中的关键酶基因,同时发现一些转录因子在调控植物脂肪酸含量和组成中具有重要作用,并在此基础上开展了利用基因工程改良植物脂肪酸和提高植物含油量的研究,取得了一定的进展。以下系统介绍了植物脂肪酸和三酰甘油合成代谢途径中的关键酶基因以及在调控植物脂肪酸含量和组成中具有重要作用的转录因子,综述了基因工程研究所取得的成果,并对其应用前景进行了展望。
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