水稻抽穗期调控基因Hd6的PARMS标记开发与利用

彭永彬; 杜晨阳; 郑崇珂; 周晋军; 孙伟; 和亚男; 谢先芝; 《山东农业科学 》 2022 北大核心

摘要：水稻抽穗期调控基因Hd6有Hd6Nip和Hd6Kasa两个等位基因型,其中有功能的Hd6Kasa型在长日照条件下抑制抽穗,可有效应用于水稻育种工作.为提高Hd6的选择效率,本研究根据水稻品种'Kasalath'与'日本晴'在Hd6第436位密码子上的A/T变异,基于五引物扩增受阻突变体系(penta-primer amplification refrac-tory mutation system,PARMS)标记技术原理,开发了特异性PARMS标记Hd6Kasa-PARMS,并利用该标记对'蜀恢498'与'苏秀867'的回交BC2 F2群体进行Hd6等位基因的分型,成功分出Hd6Nip型、Hd6Kasa型及对应的杂合型,经进一步测序验证,基因分型的准确度达到100%;对基因分型与抽穗期表型的相关性进行Pearson相关分析,相关系数为0.858,达到极显著相关水平.综上,利用该标记可快速有效鉴定出水稻抽穗期调控基因Hd6的等位基因分型,从杂交后代群体中分离出携带Hd6Kasa基因型的单株,对提高育种效率、促进水稻生育期的遗传改良具有重要应用价值.

关键词： 水稻 抽穗期 Hd6 PARMS标记 等位基因分型