科研产出
利用单片段代换系研究水稻抽穗期等位基因变异
《华北农学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为了研究水稻单片段代换系（Single segment substitution line, SSSL）与受体亲本HJX74（Huajingxian 74）抽穗期差异的原因,以HJX74和5个具有抽穗期差异显著性的SSSLs WY18（W06-15-18-3-11）、WY24（W08-16-3-2）、WY26（W11-15-7-1-1）、WY60（W15-3-1-38）、WY61（W17-10-5-5-35-9-2）为试验材料,对其代换片段上已知的抽穗期等位基因进行克隆,获取其CDS序列,用多种生物信息学方法进行序列比对,包括CDS序列、氨基酸序列,比较其氨基酸理化性质的异同及表达的差异。田间抽穗期表型性状调查结果表明,WY18、WY60、WY61相对于HJX74表现为晚抽穗,WY24、WY26表现为早抽穗。与HJX74相比,WY18代换片段上抽穗期等位基因DTH8存在4个SNP的差异、WY26中OsDof12存在7个SNP的差异、WY60 DTH8存在6个SNP的差异,但以上SNP的突变均未改变其氨基酸序列的亲水性及理化性质,表明这些抽穗期等位基因的突变可能并不是引起其抽穗期变化的原因。进一步通过qRT-PCR技术分析发现,WY18中DTH8、WY26中OsDof12的表达水平整体高于HJX74中的相应基因,表明该等位基因上游调节区域对其基因的表达进行了调控,可能是导致其抽穗期变异的原因。WY24中se14、WY61中Hd1存在明显的序列片段缺失,造成se14和Hd1等位基因功能缺失,可能是WY24、WY61抽穗期变异的主要原因。
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水稻抽穗期QTL qHD3的精细定位
《核农学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为鉴定和定位水稻抽穗期基因(QTLs),以受体相同而供体不同的2个单片段代换系为材料,使用单片段代换系之间杂交发展的衍生分离群体(F3和F4),对水稻抽穗期QTL-q HD3展开遗传和精细定位研究。在作图群体中,早抽穗和晚抽穗植株数符合3∶1的分离比,早抽穗表现为显性。应用S1-27和D19随机群体(266和879个单株)将q HD3初步定位于第3染色体短臂SSR标记RM14314和RM569之间,遗传距离分别为0.3~0.4和2.0~2.2 c M。应用D19分离群体的6 680个单株对q HD3进行精细定位,经重组分析,最终将q HD3定位在RM14314和RM14320之间约62.4 kb的染色体区间,该染色体区间共发现7个可表达的基因克隆,其中Os MADS50可能与q HD3等位。该研究结果为q HD3基因克隆及功能分析提供了理论依据。
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基于单片段代换系的水稻抽穗期QTL定位及上位性分析
《山东农业科学 》 2013
摘要：抽穗期是水稻重要的农艺性状,它决定水稻品种的地域适应性和季节适应性,是重要的育种目标之一.本研究从两个水稻单片段代换系杂交分离群体中筛选到8个次级单片段代换系和2个双片段聚合系,经重叠群作图分析,鉴定出2个与抽穗期有关的QTL.qHD3位于第3染色体短臂,qHD6位于第6染色体的短臂中部.在长日照条件下,Lemont的qHD3等位基因可促进水稻早抽穗,Tetep的qHD6等位基因则延迟水稻抽穗.另外,上位性分析表明,在长日照条件下,qHD3和qHD6之间存在着显著的上位性互作效应.
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水稻抽穗期基因上位性互作分析
《山东农业科学 》 2012
摘要：抽穗期是水稻最重要的农艺性状之一,决定着水稻生长的地域适应性和季节适应性。本试验利用具有相同遗传背景的华粳籼74的3个单片段代换系来研究水稻抽穗期。通过抽穗期鉴定,W23-03-08-9-1带有基因qHD3-1,W4-47-68-5-4-5与W12-28-58-03-19-2分别带有基因qHd6-1W12、qHd6-1W4。以分子标记辅助选择,单片段代换系W23-03-08-9-1分别与W4-47-68-5-4-5、W12-28-58-03-19-2聚合,筛选出纯和双基因聚合系,并分析qHD3-1与qHd6-1W12、qHd6-1W4间上位性互作。结果显示,来源于第3染色体的单片段代换系W23-03-08-9-1的基因qHD3-1对来源于第6染色体的代换片段W4-47-68-5-4-5与W12-28-58-03-19-2上的基因qHd6-1W12、qHd6-1W4显上位。
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水稻单片段代换系抽穗期QTL鉴定及遗传分析
《山东农业科学 》 2011
摘要：适宜的抽穗期是水稻(Oryza sativa)获得理想产量的前提。本研究利用带有晚抽穗基因的单片段代换系(SSSL)为供体,华粳籼74为受体亲本,发展F2次级分离群体。通过t测验比较单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间抽穗期的差异,同时对代换片段上的抽穗期QTL进行鉴定。以P≤10-6为阈值鉴定出抽穗期QTL,此QTL位于水稻的第6染色体。调查记录F2次级分离群体单株抽穗期,并对统计结果进行卡方(χ2)测验。结果显示,F1代单株表现为早抽穗,F2代早抽穗和迟抽穗植株数符合3∶1的分离比,早抽穗表现为显性。
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水稻极晚抽穗期基因的鉴定和遗传分析
《山东农业科学 》 2009
摘要：水稻抽穗期是重要的农艺性状。本研究以一个带有华粳籼74遗传背景的单片段代换系为试验材料,对水稻抽穗期基因进行评价,发现单片段代换系W06-26-35-1-5-2带有极晚抽穗期基因,在山东种植,抽穗期稳定且表现为晚抽穗。该代换系的代换区间为PSM152-PSM154-PSM155-RM25-RM547-RM72-RM404,在第8染色体上带有抽穗期基因qHD8-1。对该代换系与受体亲本华粳籼74杂交发展的F2分离群体的单株进行抽穗期鉴定,发现晚抽穗和早抽穗单株数符合3∶1的分离比,说明晚抽穗为一个显性基因控制。
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