科研产出
大豆干旱响应GRAS基因筛选及GmGRAS27的生物信息学和逆境表达分析
《大豆科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:GRAS转录因子在植物抵抗非生物胁迫过程中发挥了重要作用,为了研究大豆GRAS基因在干旱胁迫中的响应,以挖掘大豆GRAS转录因子在干旱等非生物胁迫响应中的功能和分子机制提供分子基础,本研究利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)筛选响应干旱胁迫的大豆GRAS基因,利用PlantCARE分析其启动子中的顺式作用元件。进一步对在营养生长时期(V6)和盛花期(R2)均受到干旱胁迫强烈诱导的GRAS基因GmGRAS27进行克隆和生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR方法分析干旱、盐和ABA胁迫下GmGRAS27基因的表达情况。结果显示:从大豆117个GRAS基因中筛选出10个响应干旱胁迫的GRAS基因,其启动子序列中均至少含有1个激素或逆境胁迫应答相关元件,GmGRAS27(Glyma.06G265500)基因的启动子同时含有ABRE应答元件和MYB/MYC结合元件。GmGRAS27在V6和R2期均受到干旱胁迫的强烈诱导,其编码的蛋白质GmGRAS27含有典型的GRAS基因家族结构域,高级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。实时荧光定量PCR分析显示GmGRAS27不仅受到干旱胁迫的强烈诱导,还受到盐胁迫和ABA的正向调控。推测GmGRAS27不仅是大豆干旱胁迫的重要候选基因也可能响应其他非生物胁迫。
关键词: 大豆 干旱 GRAS GmGRAS27 生物信息学 逆境胁迫 表达分析
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AhSOS2转基因水稻基因表达及抗逆性分析
《山东农业科学 》 2017
摘要:SOS2(salt overly sensitive 2)作为植物中一类重要的耐盐相关基因,在调控细胞内离子平衡、参与植物对盐害的响应及适应过程中具有重要作用。前期已从花生叶片中分离到基因AhSOS2(Gen Bank登录号为HG797656),其属于SOS2类基因,编码446个氨基酸,为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。本研究以该基因的转基因水稻株系SOS2-1、SOS2-2、SOS2-3、SOS2-7为材料进行荧光定量PCR,分析基因转录表达情况。结果发现,AhSOS2基因在四个转基因株系中均有表达,且在株系SOS2-3中的表达量高于其它株系。对转基因水稻株系进行250 mmol/L Na Cl处理后,检测其相对电导率和脯氨酸、MDA含量,以及抗氧化酶SOD、POD、CAT、APX酶活等胁迫相关的生理指标。结果显示,胁迫条件下,转基因水稻株系相对电导率低于对照,参与胁迫响应的酶活高于对照,说明AhSOS2对提高受体材料的抗盐及抗胁迫能力具有一定作用。该结果为进一步研究AhSOS2及SOS2基因家族功能、解析其对盐害等逆境的适应机制奠定基础。
关键词: 水稻 SOS2基因家族 AhSOS2 表达模式 生理指标 逆境
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植物VQ蛋白研究进展
《农业生物技术学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要:VQ蛋白是一类与生长发育以及响应外界环境胁迫等功能相关的植物特异性转录调控辅助因子,其氨基酸序列仅在VQ结构域:"Fxxx VQx LTG"(其中x代表任意氨基酸)处高度保守,而其他位置的序列则相对多变。大部分VQ蛋白分布在细胞核中,仅有少部分分布于细胞质或者线粒体中。另外,基因特征分析发现,超过80%的VQ基因不含有内含子。对其生物学功能的研究发现,VQ蛋白不仅参与种子、下胚轴、花、叶等器官的生长发育,而且还参与对干旱、盐、温度以及病原菌的胁迫应答。本文综述了近年来国内外关于VQ基因的研究进展,主要包括VQ的蛋白、基因特征,功能及作用机制,以期为VQ蛋白的进一步研究和利用提供一些有益的启发。
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组蛋白去乙酰化酶(HDACs)及其在植物中的作用
《生物技术通报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是一个在真核生物(包括酵母、哺乳动物和植物)中广泛存在的超基因家族。HDACs与组蛋白乙酰基转移酶(HATs)共同作用来调节组蛋白乙酰化的状态,从而影响染色体的结构和功能,调节基因的转录和细胞的多种功能。目前,人们对植物HDACs的研究逐渐增多,很多HDAC基因在不同植物中得到鉴定和研究。综述了HDACs的分类以及在植物生长发育和胁迫反应中的作用,旨在为进一步研究HDAC在植物中的表观遗传调控机理以及培育抗逆新品种奠定理论基础。
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绿盲蝽为害对不同空间位置桃叶生理指标的影响
《植物保护学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:为明确绿盲蝽为害不同时期桃树的应激反应发生发展过程,采用生化测定方法分析了桃树上、中、下部不同受害程度叶片内的可溶性糖、蛋白质、游离氨基酸含量以及防御性酶活性的变化。结果表明,绿盲蝽为害后,随着时间的延长,受轻度为害的桃树叶片内可溶性糖含量由28.61 mg/g减少至19.21 mg/g,蛋白质含量由1.29 mg/g先增加至2.01 mg/g,后减少至1.66 mg/g,游离氨基酸含量由0.49 mg/g增加至0.72 mg/g;而受重度为害的叶片内可溶性糖和蛋白质的含量均先减少后增加,游离氨基酸含量则先增加后减少。防御性酶活性随绿盲蝽为害程度的加重也发生了不同程度的变化,随着时间的延长,受轻度为害的叶片内超氧化物歧化酶活性降低,过氧化物酶和过氧化氢酶活性有所升高;而受重度为害的叶片内超氧化物歧化酶活性先降低后升高,过氧化物酶活性升高,过氧化氢酶活性降低。说明不同位置桃树叶片对绿盲蝽的为害胁迫产生了应激反应,通过调整其体内各种防御性物质的含量,对绿盲蝽为害产生诱导抗性,且与为害程度有一定的相关性。
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小麦细胞色素P450(TaP450)基因的克隆与序列分析
《麦类作物学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要:细胞色素P450是一种多功能氧化酶,在植物体内担当着生物合成、代谢解毒以及抗逆等重要功能。本研究采用RACE方法从普通小麦中同源克隆到一个新的P450基因,命名为TaP450(Genbank No.KJ541960)。该基因基因组序列全长为2 643bp,含有2个外显子和1个内含子,cDNA全长为2 033bp,含有一个1 557bp的开放读码框,推导蛋白含518个氨基酸;序列分析发现其具有保守的P450结构域,但该蛋白与已报道的小麦P450蛋白序列有较大差异,表明它是小麦P450家族的新成员;蛋白结构特征分析发现,该蛋白的分子量为57.092kD,等电点为8.63,N端具有一个含29个氨基酸的跨膜结构和一个含22个氨基酸的信号肽,亚细胞定位分析表明该蛋白属于分泌蛋白。其在小麦叶片、茎、根与种子中均有表达,但在叶片和茎中表达量最高;在胁迫处理下,该基因的表达量均上调,且在盐胁迫处理下上调尤为显著,表明该基因与盐胁迫密切相关。
关键词: 小麦 RACE 细胞色素P450 特异性表达 逆境胁迫
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