科研产出
VRTN基因SINE插入突变与杜洛克肋骨数、胴体及肉质性状关联分析
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析椎骨发育相关(Vertebrae development associated,VRTN)基因的1段291 bp短散在重复序列(Short interspersed repeated sequence,SINE)插入突变对杜洛克猪肋骨数、胴体和肉质性状的影响,为实施分子标记辅助育种,提高杜洛克的肋骨数奠定基础.[方法]屠宰48头杜洛克猪,按照标准方法测定肋骨数、胴体和肉质性状,利用PCR检测VRTN基因的基因型,分析SINE插入突变3种基因型与肋骨数、胴体和肉质性状的关联.[结果]杜洛克猪中VRTN基因ins位点存在插入型(ins/ins)、杂合性(ins/-)和缺失型(-/-)3种基因型,ins/ins基因型频率最高(0.5217),其次是ins/-基因型(0.3696),-/-基因型频率最低(0.1087).-/-基因型的杜洛克猪肋骨数为14,ins/-基因型的杜洛克猪肋骨数为15,大多数ins/ins基因型的杜洛克猪肋骨为16根,少数杜洛克猪为15根,平均为15.82根.ins/ins基因型的杜洛克猪比-/-基因型的杜洛克猪的肋骨提高1.82根,差异极显著(P<0.01).另外,ins/ins基因型杜洛克比-/-基因型杜洛克胴体长、瘦肉率和乳头数分别增加4.05 cm、3.3个百分比、2.26个,2种基因型间差异达显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)水平.ins/ins基因型杜洛克猪的胴体长、瘦肉率和乳头数虽然均比ins/-基因型有所提高,但未达到显著水平.ins/ins基因型、ins/-基因型和-/-基因型杜洛克猪的眼肌面积分别为45.38、49.03和50.02 cm2,SINE插入突变有降低眼肌面积的趋势,但未达到显著水平.SINE插入突变对屠宰率、肌内脂肪、嫩度等性状没有影响.[结论]VRTN基因SINE插入突变具有一因多效的作用,其育种价值多是正向的.本研究明确了 VRTN基因在杜洛克猪中的遗传效应,为该标记在猪分子标记辅助选择中的应用提供了重要参考.
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枣庄黑盖猪群体中脊椎数候选基因的多态性与遗传分析
《养猪 》 2018
摘要：为了解枣庄黑盖猪种质特性,研究利用PCR和PCR-RFLP方法对影响脊椎数的2个候选基因NR6A1和VRTN在枣庄黑盖猪群体中的多态性进行检测,并应用生物学软件进行群体遗传分析及Hardy-Weinberg平衡检验。结果表明:枣庄黑盖猪群体中NR6A1基因c.575 A>G位点有AA、AG和GG 3种基因型,AA基因型为优势基因型,VRTN基因存在ins/ins、ins/-和-/-3种基因型,缺失型基因型(-/-)为优势基因型,而且NR6A1和VRTN基因突变位点为中度多态,处于Hardy-Weinberg平衡状态。由此可见枣庄黑盖猪以前没有对NRA61和VRTN基因的突变位点进行选育,利用分子标记辅助选择可快速提高这两个基因的有利基因型频率,从而提高黑盖猪群体的脊椎数。
关键词： 枣庄黑盖猪 脊椎数 NR6A1 VRTN 多态性 标记辅助选择
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