鲁中肉羊TSHR多态性与产羔数的关联及生物信息学分析

陈炜昊; 潘林香; 王金文; 马琳; 孙伟; 储明星; 《基因组学与应用生物学 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：本研究旨在探究TSHR基因g.89431097C>G位点多态性与鲁中肉羊产羔数之间的关系,并进行相关生物信息学分析,以期为TSHR基因编码蛋白功能机制研究提供基础数据并为鲁中肉羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记.利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY^?SNP技术对鲁中肉羊TSHR基因g.89431097C>G位点进行检测,并与其产羔数进行关联分析,利用Protparam等软件对TSHR基因进行生物信息学分析.分型结果表明:g.89431097C>G位点存在GG、GC和CC 3种基因型;群体遗传学分析表明,g.89431097C>G位点在鲁中肉羊中表现为中度多态(0.250.05);关联分析表明,g.89431097C>G位点GG型第一胎、第二胎、第三胎产羔数均显著高于GC与CC型(p<0.05).生物信息学分析表明绵羊TSHR基因编码764个氨基酸组成不稳定碱性疏水性蛋白,存在信号肽,存在7个跨膜域,预测存在6个N-糖基化位点、6个O-糖基化位点和85个磷酸化位点,预测存在二硫键,绵羊与山羊、家牛等12个物种TSHR基因编码区生物进化高度保守.

关键词： 鲁中肉羊 TSHR SNP分型 产羔数 生物信息学