肠炎沙门氏菌攻毒对SPF雏鸡粪便微生物区系的影响

王曦; 李均同; 张印; 骆延波; 任金瑞; 朱见深; 戴美学; 杜以军; 刘玉庆; 齐静; 《家禽科学 》 2021

摘要：试验旨在探究肠炎沙门氏菌攻毒对SPF雏鸡粪便微生物区系的影响。选择1日龄SPF雏鸡24只,随机分为2组,每组12只。在4日龄处理组口服107CFU肠炎沙门氏菌（ATCC13076）攻毒,对照组口服等量PBS溶液。试验期22 d。结果显示:（1）处理组SPF鸡的存活率为75%,对照组全部存活,期间两组鸡的体重无显著性差异;（2）OTU水平上,相同日龄两组鸡粪便菌群的丰富度相近,中期处理组粪便菌群多样性更高（P<0.05）,后期对照组菌群稳定性更高,而且攻毒对SPF鸡粪便菌群的影响随日龄增加而减弱;（3）在属水平上,与对照组相比,处理组Bacteroides（拟杆菌门）、Enterococcus （肠球菌属）和Aeriscardovia （卡多维亚氏菌属）的相对丰度明显升高（P<0.05）;Lactobacillus（乳杆菌属）、Alistipes（另枝菌属）、Faecalibacterium（粪杆菌属）、Romboutsia（罗姆布茨菌属）和Ruminococcaceae_UCG₀05（瘤胃球菌UCG₀05）的相对丰度明显降低（P<0.05）;（4）KEGG分析显示攻毒影响了菌群参与的多个代谢通路。综上,肠炎沙门氏菌感染影响了SPF雏鸡粪便菌群的结构组成、稳定性及菌群参与的代谢通路。Bacteroides（拟杆菌门）、Lactobacillus（乳杆菌属）等差异菌属可能对SPF雏鸡抵抗沙门氏菌入侵起到积极作用。

关键词： 肠炎沙门氏菌 SPF雏鸡 16S rRNA测序 粪便菌群 KEGG代谢通路