2006-2008年山东鸡传染性支气管炎病毒分离株S1与N基因的分子特征

路希山; 胡北侠; 黄艳艳; 孟斌; 王连珠; 王金宝; 张秀美; 《畜牧兽医学报 》 2009 北大核心 CSCD

摘要：为了调查2006-2008年山东省鸡传染性支气管炎的分子流行病学特征,应用RT-PCR方法分别扩增了14株传染性支气管炎病毒地方毒株S1基因和N基因,并进行了基因克隆与测序工作。对此14株病毒的S1基因序列利用限制性内切酶HaeⅢ进行了限制性片段长度多态性(RFLP)分析,结果显示可以将IBV毒株分为3种不同的基因型。其中11个毒株与LX4毒株有相同的RFLP分型,2株病毒属于Mass基因型,1个毒株有特异的RFLP分型。并将这些分离毒株与11个参考毒株分别进行了基因与氨基酸系统进化树关系分析。S1基因分析结果显示将这些毒株分成3个基因型,与RFLP分析的分型结果一致。11株病毒同属于LX4类型的毒株,分离毒株核苷酸序列相互之间有95.4%~99.7%的同源性。基因Ⅱ型与疫苗株H120和M41的同源性很高。属于基因Ⅲ型的1个毒株形成了独特的基因型。N基因分析结果表明:12株病毒与LX4属于同一基因型,有着较高的同源性。另2株病毒与疫苗株H120同源性很高。以上分析结果表明:山东省IBV分离株存在较为广泛的基因突变、插入和缺失,同时,IBV毒株间的基因重组也可能是山东省IBV变异株产生的另一主要原因。

关键词： 传染性支气管炎病毒 S1基因 N基因 RFLP分析 基因型