科研产出
基于大豆叶枕响应叶柄角变化转录组的MYB基因分析
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]阐明MYB基因家族成员是否参与大豆叶柄角(leaf petioles angle,LPA)变化的调控过程,为大豆理想株型育种研究奠定基础.[方法]以郑196为材料,利用大豆叶枕响应叶片向光运动转录组挖掘差异表达大豆MYB基因(GmMYB);利用ProtComp 9.0进行亚细胞定位预测;以拟南芥MYB蛋白序列为参考,采用MEGA v5.0软件进行系统进化分析;分别利用在线程序MEME和PlantPAN3.0分析差异表达MYB基因保守基序(motif)和启动子序列的顺式作用元件;以NCBI数据库中大豆转录组数据及RNA-seq数据为基础,采用TBtools进行表达模式分析,并在此基础上进行候选基因的精准定量检测.[结果]①鉴定出13个差异表达GmMYB,其中上调表达9个,下调表达4个;亚细胞定位结果表明,11个MYB蛋白位于细胞核,2个位于细胞外基质.②基于MYB蛋白序列构建系统进化树,可将13个差异表达GmMYB分为6组.③对13个差异表达GmMYB基因结构进行分析,结果共鉴定到10个基序,其中基序1和基序2是MYB保守结构域的一部分.④在启动子区域鉴定获得脱落酸响应元件、参与干旱响应元件、响应光照的顺式作用元件、分生组织表达和生长素响应等多个响应逆境胁迫及光照的顺式作用元件.⑤表达模式分析结果表明,13个差异表达GmMYB基因在大豆不同组织器官中存在表达差异,其中Glyma.01G190100 和 Glyma.08G042100 在叶枕处表达.⑥对 Glyma.01G190100 和 Glyma.08G042100 进行精准定量检测,结果显示其相对表达量在叶片向光运动前后变化剧烈,可作为大豆叶柄角调控候选基因用于进一步研究.[结论]鉴定出13个与大豆叶柄角调控相关的MYB基因,其中Glyma.01G190100和Glyma.08G042100可作为大豆叶柄角调控候选基因用于大豆理想株型育种研究.
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冬枣果皮着色相关类黄酮靶向代谢组学及潜在MYB转录因子分析
《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：以冬枣白熟期(W)、半红期(着色部分SR_R,未着色部分SR W)、全红期(R)果皮为试材,通过靶向代谢组学分析不同着色期冬枣果皮类黄酮组分及变化,构建冬枣MYB家族进化树,通过转录组分析潜在调控类黄酮合成MYB转录因子.结果表明,着色期4个比较组果皮差异代谢物分别为291(Rvs W)个、196(RvsSR_W)个、297(SR R vs SR_W)个和 201(SR RvsW),其中共有差异代谢物98个.通过KEGG分析发现共有的差异代谢物主要富集在次生代谢物、苯丙烷类和类黄酮生物合成途径;126个类黄酮物质在果皮着色期被检测到,其中包括13个花青苷类物质、53个黄酮物质、28个黄酮醇类物质、8个异黄酮、5个原花青素和19个黄烷醇类物质;随着冬枣果皮着色,3个花翠素、3个黄酮和3个黄酮醇类物质显著增加,而原花青素和黄烷醇类物质儿茶素、表儿茶素显著减少.冬枣MYB家族聚类共筛选出14个潜在调控类黄酮生物合成的MYB转录因子.进一步通过转录组和qRT-PCR分析发现有12个MYB转录因子随冬枣果皮着色呈下调表达趋势,仅LOC107434709和LOC107404750两个MYB转录因子在着色冬枣果皮中表达水平较高,暗示其可能在冬枣着色过程中发挥积极作用.
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欧洲葡萄VvMYB6正向调控花青素合成
《园艺学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：从欧洲葡萄‘粉红亚都蜜’中克隆到1个MYB转录因子基因VvMYB6。VvMYB6蛋白定位在细胞核,其N端包含1个保守的R2R3结构域。在葡萄中,VvMYB6主要在在根、花器官及果实发育早期表达。在烟草中异位表达VvMYB6,显著促进花瓣和雄蕊中花青素的积累;代谢组分析发现,相比野生型,转基因植株花中累积高含量的飞燕草色素和矢车菊色素。转基因烟草植株中查尔酮合酶（CHS）、查尔酮异构酶（CHI）、黄烷酮4–还原酶（DFR）、花青素合酶（ANS）和UDP葡萄糖–类黄酮–O–葡萄糖基转移酶（UFGT）基因表达显著上调。结果表明VvMYB6正向调控花青素合成。
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杜梨2个MYB转录因子基因的克隆及序列分析
《果树学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：【目的】克隆杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)MYB家族的2个基因(Pb3RMYB和Pb4RMYB),分析其序列特征,为研究其调控的分子机制奠定基础。【方法】利用RT-PCR和RACE技术克隆杜梨Pb3RMYB和Pb4RMYB的c DNA序列全长;利用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、TMHMM、Signal P、Plant-m Ploc、SPOMA、DANMAN、MEGA6等软件对氨基酸序列进行分析。【结果】克隆得到Pb3RMYB和Pb4RMYB基因全长,Gen Bank登录号分别为KX272614和KX272615。2者均含有MYB保守结构域,二级结构均以无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-折叠为主,亚细胞定位分析表明2者均定位于细胞核中。其中,Pb3RMYB属于3R-MYB亚家族,全长2 355 bp,ORF长1 710bp,编码569个氨基酸,蛋白分子质量约为62 077.3 Da,等电点为7.08;BLAST分析表明Pb3RMYB与已报道的其他物种3RMYB具有较高的相似度。Pb4RMYB属于4R-MYB亚家族,全长3 625 bp,ORF长2 913 bp,编码970个氨基酸,蛋白分子质量约为109 600.6 Da,等电点为7.41。【结论】获得了2个杜梨MYB基因Pb3RMYB和Pb4RMYB,分别属于3RMYB和4R-MYB亚家族。
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棉花转录因子基因(GhMYB11)的克隆与表达分析
《农业生物技术学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：MYB基因家族在植物应对外界生物和非生物胁迫的过程中有重要的调控作用。本研究利用二倍体雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)基因组数据库,从陆地棉(G.hirsutum)品种鲁棉研32号中克隆到一个新的MYB转录因子Gh MYB11(Gen Bank登录号:HQ234875.1),c DNA全长1 001 bp,开放阅读框828bp。通过与模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)和主要作物小麦(Triticum aestivum L.)、玉米(Zea mays L.)、水稻(Oryza sativa L.)MYB蛋白的氨基酸序列比对发现,Gh MYB11蛋白与拟南芥中脱落酸(abscisic acid,ABA)合成和信号传导的重要基因At MYB13/14编码的蛋白高度相似(E值分别为7e-83和1e-90),含两个高度保守的MYB结构域R2R3及一个转录激活结构域。实时定量PCR分析发现,Gh MYB11基因在黄萎病菌(Verticillium dahliae)侵染、干旱、盐和氧化胁迫处理后的棉花幼苗叶片中表达显著上调。Gh MYB11基因可能在棉花生物和非生物胁迫反应中起重要调控作用,是陆地棉品种抗逆性遗传改良的重要候选基因。本研究为利用基因工程手段提高棉花抗逆性提供了基础材料
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MYB转录因子在植物盐胁迫调控中的研究进展
《植物生理学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：盐胁迫是影响植物生长、发育及作物产量的重要环境因子。在植物响应高盐胁迫的过程中,许多基因被激活,并产生了许多抵御盐胁迫的蛋白。这些胁迫诱导基因的表达大多由转录因子调控。MYB转录因子广泛存在于真核生物中,是一类数量较多、功能多样的转录因子家族。MYB蛋白在包括盐胁迫在内的植物非生物胁迫调控中有重要作用。MYB转录因子在结构上具有多样性,因此对植物盐胁迫的调控机制较为复杂。近年来,随着研究手段的提高,MYB家族转录因子,尤其是R2R3-MYB,在盐胁迫调控中的作用机制得到了较为深入的研究。此外,越来越多的MYB-related蛋白也被证实参与了植物盐胁迫的调控。本文论述了MYB转录因子的结构特征和不同类型MYB蛋白在盐胁迫调控中的功能及作用机制,以期为MYB转录因子的研究和利用提供参考。
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