中华猕猴桃GRAS基因家族鉴定及低温胁迫表达分析

毛可欣; 王海荣; 安淼; 刘腾飞; 王世金; 李健; 李国田; 《生物技术通报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：GRAS基因家族广泛参与植物生长和逆境响应,而低温是制约猕猴桃生产和分布的重要因素之一,鉴定猕猴桃GRAS基因家族,分析其在低温胁迫中的表达情况,为猕猴桃的抗寒研究和品种选育提供理论依据.以中华猕猴桃'红阳'基因组为参考进行GRAS家族保守结构域比对,通过对鉴定到的家族成员进行系统进化树、蛋白理化性质、基因结构、蛋白三级结构、蛋白质motif、顺式作用元件、共线性、密码子偏好性和基因表达模式等进行分析.结果表明,猕猴桃基因组共存在 79 个GRAS家族成员,分属于 8 个亚家族,且各亚家族基因、蛋白结构有所差异.顺式作用原件分析显示该家族基因参与多种植物激素、生长发育以及胁迫响应.密码子偏好性分析发现,该家族密码子第 3 位碱基更偏好使用嘧啶类碱基(G/T).鉴定到 6 个基因可能参与猕猴桃低温胁迫过程,并进行荧光定量PCR验证了该猜测.该研究补充了猕猴桃GRAS基因家族鉴定分析的空白,为猕猴桃抗寒研究奠定分子基础.

关键词： 猕猴桃 GRAS基因家族 密码子分析 低温胁迫