基于全基因组水平的花生FAR1转录因子家族分析

赵小波; 李春娟; 孙全喜; 王奇; 牟艺菲; 王娟; 苑翠玲; 姜常松; 单世华; 《花生学报 》 2024 北大核心

摘要：FAR1是一类起源于转座子酶的转录因子，在光敏色素A(phyA)信号通路的启动中起到非常重要的作用。基于全基因组水平对其家族分析，可为深入研究FAR1基因在花生生长发育、逆境胁迫响应中的分子调控机理提供依据。本研究在花生基因组中共鉴定出60个FAR1基因，该转录因子家族成员分成3个亚组，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ亚组中分别包含了21、20和19个花生FAR1蛋白。65%直系同源基因的Ka/Ks值小于0.5,这些基因结构稳定、较为保守，经历了较强的负选择作用。转录组数据分析发现，大部分FAR1基因在花生叶片中表达。本研究结果有助于了解花生FAR1基因家族的进化与功能，为下一步深入研究该基因家族的功能提供依据。

关键词： 花生 FAR1转录因子 生物信息学