肉鸡气管阻塞呼吸系统细菌多样性分析

李玉保; 王守荣; 刘玉庆; 朱明霞; 吴伟胜; 朱育玮; 《中国兽医学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：采用第2代Miseq高通量测序方法对发病和健康鸡只的肺脏和气管内微生物进行检测,并分析各样品中菌种类别、群落组成、不同样品之间物种差异以及与疾病发生的关系。结果显示:肺脏和气管内共检测到270种细菌,它们隶属于13门23纲39目74科140属;病例气管中细菌数比肺脏高,同时也比健康气管略有增多,而多数病例肺脏内细菌数比健康肺脏少。结果表明:不同样品之间存在一定的物种差异,地域对样品中细菌组成影响较大,引发肉鸡气管阻塞的细菌病原体也存有不同,主要有支原体、大肠杆菌、志贺菌、里氏杆菌、棒状杆菌、葡萄球菌、鸟杆菌和肠球菌等;此外,所占比例较大的乳酸球菌和乳酸杆菌是益生菌。

关键词： 肉鸡气管阻塞 Miseq测序 呼吸系统 细菌多样性 群落组成