科研产出
肠炎沙门氏菌攻毒对SPF雏鸡粪便微生物区系的影响
《家禽科学 》 2021
摘要：试验旨在探究肠炎沙门氏菌攻毒对SPF雏鸡粪便微生物区系的影响。选择1日龄SPF雏鸡24只,随机分为2组,每组12只。在4日龄处理组口服107CFU肠炎沙门氏菌（ATCC13076）攻毒,对照组口服等量PBS溶液。试验期22 d。结果显示:（1）处理组SPF鸡的存活率为75%,对照组全部存活,期间两组鸡的体重无显著性差异;（2）OTU水平上,相同日龄两组鸡粪便菌群的丰富度相近,中期处理组粪便菌群多样性更高（P<0.05）,后期对照组菌群稳定性更高,而且攻毒对SPF鸡粪便菌群的影响随日龄增加而减弱;（3）在属水平上,与对照组相比,处理组Bacteroides（拟杆菌门）、Enterococcus （肠球菌属）和Aeriscardovia （卡多维亚氏菌属）的相对丰度明显升高（P<0.05）;Lactobacillus（乳杆菌属）、Alistipes（另枝菌属）、Faecalibacterium（粪杆菌属）、Romboutsia（罗姆布茨菌属）和RuminococcaceaeUCG005（瘤胃球菌UCG005）的相对丰度明显降低（P<0.05）;（4）KEGG分析显示攻毒影响了菌群参与的多个代谢通路。综上,肠炎沙门氏菌感染影响了SPF雏鸡粪便菌群的结构组成、稳定性及菌群参与的代谢通路。Bacteroides（拟杆菌门）、Lactobacillus（乳杆菌属）等差异菌属可能对SPF雏鸡抵抗沙门氏菌入侵起到积极作用。
关键词： 肠炎沙门氏菌 SPF雏鸡 16S rRNA测序 粪便菌群 KEGG代谢通路
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SPF鸡和商品蛋鸡粪便菌群及大肠杆菌抗药性的比较分析
《家禽科学 》 2019
摘要：通过粪菌移植可以调节肠道菌群的组成,已成为降低肠道菌群抗药性的方法之一,而筛选合适的粪菌移植供体尤为重要.本研究利用16S Rrna基因高通量测序技术分析了两种候选供体SPF鸡和商品蛋鸡在不同养殖模式下5个不同日龄粪便菌群的组成,并利用药物敏感性试验比较了粪便中大肠杆菌的抗药性水平.结果表明,两种蛋鸡粪便菌群的丰富度都表现出随日龄增加而增加的趋势,其中商品蛋鸡粪便菌群的种类更加丰富,而SPF鸡粪便菌群的组成更加均一.在门水平上,SPF鸡拥有更多的厚壁菌门细菌,而商品蛋鸡含有更多的变形菌门、拟杆菌门和放线菌门细菌.在属水平上,两种蛋鸡粪便中的优势菌均为乳酸杆菌属和埃希氏-志贺氏菌属,其中SPF鸡存在更多的乳酸菌属和隐秘杆菌属,而商品蛋鸡含有更多的拟杆菌属、假单胞菌属、不动杆菌属、梭菌属、链球菌属和克雷伯菌属.药敏试验结果表明,SPF鸡粪便中大肠杆菌对抗生素的抗药率、多重抗药性比例和最低抑菌浓度(MIC)的频率分布均显著低于商品蛋鸡.该结果深入分析了两种养殖模式下不同日龄蛋鸡的粪便菌群,结合粪便中大肠杆菌抗药性水平的比较分析,进一步表明SPF鸡粪便菌群更加安全、敏感,可以作为粪菌移植的供体用于降低肠道菌群的抗药性.
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