基于SSR标记的石榴品种遗传多样性分析和指纹图谱构建

冯立娟; 程云; 王传增; 焦其庆; 尹燕雷; 《山东农业科学 》 2023 北大核心

摘要：为明确国内主产区不同主栽石榴品种的遗传多样性,构建DNA指纹图谱,本研究以 30 个石榴品种为试材,利用琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳筛选多态性引物,建立了石榴品种SSR分子标记鉴定体系,然后利用样品信息与指纹代码配置组合的串联代码,构建了不同石榴品种的DNA指纹图谱.结果表明,从 36 对引物中筛选出扩增产物条带清晰稳定、多态性高的引物 10 对,共检测出 48 个等位基因,平均为4.8个,观察杂合度和期望杂合度平均分别为 0.50 和 0.60,Shannon's 指数和Nei's多样性指数平均分别为 1.11 和 0.59,多态信息含量在 0.33~0.72 之间,平均为 0.53.聚类分析发现,30 个品种被分为 3 组,A组包括 16 个品种,B组包括 8 个品种,C组包括 6 个品种.基于样品、引物和等位基因信息,构建了 30 个品种的特异指纹代码及指纹图谱二维码.本研究结果可为石榴种质资源分子鉴定及开发利用提供理论依据.

关键词： 石榴品种 SSR分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱