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资源类型: 中文期刊
关键词:分子进化(模糊匹配)
共2条记录
2016年~2018年山东地区25株H9N2亚型禽流感病毒分子分析

《中国预防兽医学报 》 2019 北大核心 CSCD

摘要:H9N2亚型禽流感(AI)持续在我国鸡群中广泛流行,为了明确山东及周边养殖场H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的分子进化情况,本研究对2016年~2018年间从山东及周边养殖场病鸡中分离鉴定得到的25株H9N2亚型AIV分别纯化后进行全基因组测序和遗传演化分析,并分析序列中重要氨基酸位点的变异情况.全基因组序列分析显示:25株H9N2 AIV 8个基因节段均属于欧亚谱系,但8个基因节段的分子进化关系呈现出基因多样性:HA、NA基因来自Y280-like,25株分离株HA基因之间的同源性为92.8%~99.9%,NA基因之间的同源性为91.0%~99.9%;PB2基因来自G9-like;PB1、PA、NP、NS基因来自F98-like;M基因来自G1-like.HA蛋白的受体结合位点149、198、234和235位点变异最多,25株分离株HA均出现Q234L突变(相当于H3第226位氨基酸);21株分离株在HA蛋白218~300位糖基化位点缺失,所有分离株均在313~315位出现潜在的糖基化位点;仅3株分离株的NA蛋白在402位出现糖基化位点,而NA蛋白在264位有11株分离株出现了潜在糖基化位点;5株分离株在PB2蛋白的627位点发生变异,1株在PB2蛋白的714位点发生变异.以上结果表明,近3年山东周边地区流行的H9N2 AIV是由不同进化方式而来,部分重要氨基酸位点出现了变异,具有潜在感染哺乳动物的可能性,因此需加强H9N2 AIV的分离鉴定,密切监测其遗传变异情况.

关键词: H9N2亚型禽流感病毒 分子进化 糖基化 突变 HA基因

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4株鸭坦布苏病毒包膜蛋白基因的分子进化分析及表达

《中国兽医学报 》 2013 北大核心 CSCD

摘要:从规模化养鸭场分离到4株鸭坦布苏病毒,成功克隆了包膜蛋白(E蛋白)基因片段,并对其进行了序列测定、分析和表达。结果表明,E基因全长1 503bp,编码501个氨基酸,序列高度保守。进化分析显示,鸭坦布苏病毒属蚊媒黄病毒类恩塔亚病毒群,与其他坦布苏病毒及近期发现的BYD病毒关系最近。采用原核表达系统对E基因进行了表达,蛋白大小54 300,主要以包涵体形式存在。随后,对E蛋白外功能区序列和3D结构进行了分析,在已解析结构的黄病毒中与WNV E结构最为相似。研究结果为该病的防控和基因工程疫苗的研制奠定了基础。

关键词: 鸭坦布苏病毒 包膜蛋白基因 分子进化

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