大白菜eIF(iso)4E.a假基因突变体的鉴别及相关检测标记的开发

刘栓桃; 张志刚; 李巧云; 王淑芬; 卢金东; 张晓燕; 徐文玲; 刘贤娴; 付卫民; 赵智中; 《中国农学通报 》 2014 北大核心 CSCD

摘要：马铃薯Y病毒在侵染寄主时与eIF4E或eIF(iso)4E的相互作用是一种普遍机制。大白菜病毒病主要病源是TuMV,TuMV在侵染大白菜时能同时与eIF4E和eIF(iso)4E发生作用,且在大白菜基因组中上述2基因各有3个拷贝。因而鉴定大白菜资源在上述2个位点的多样性、发现各位点的功能缺失突变体至关重要。采用同源克隆和Tail-PCR技术,鉴定了12份大白菜抗/感TuMV材料中eIF(iso)4E.a位点的多样性。结果表明:5份材料的eIF(iso)4E.a基因组序列完整,但与已知序列相比均存在显著差异,包含3种新的单倍型;7份材料的eIF(iso)4E.a缺失了第4、5外显子及3'端约1 kb的大片段,是个假基因。同时开发了鉴别完整基因与假基因的共显性标记。该策略为鉴定大白菜中eIF4E和eIF(iso)4E其他位点的多样性提供了借鉴,开发的相关检测标记可以作为标记辅助选择的工具用于创新抗病毒大白菜新种质及培育抗病毒大白菜新品种。

关键词： 大白菜 真核生物翻译起始因子异构体 突变体 共显性标记