您好,欢迎访问山东省农业科学院 机构知识库!

甘薯CLE多肽家族的全基因组鉴定和IbCLE12的克隆及抗旱性表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周媛媛 1 ; 赵春玲 2 ; 侯夫云 1 ; 李爱贤 1 ; 秦桢 1 ; 王庆美 1 ; 董顺旭 1 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院作物研究所

2.山东师范大学

关键词: 甘薯;CLE多肽;生物信息学分析;IbCLE12;基因表达;抗旱性

期刊名称: 山东农业科学

ISSN:

年卷期: 2023 年 005 期

页码: 1-7

摘要: CLAVATA3/Embryo surrounding region-related(CLE)多肽作为植物体内小分子信号激素,在植物的生长发育和抗逆性中发挥重要的调控作用。本研究从甘薯近缘野生种Ipomoea trifida的基因组数据库中筛选出12个ItfCLE基因,并对其结构、蛋白理化性质、进化关系以及转录水平的表达进行了分析。结果表明,12个ItfCLE蛋白的长度和分子量分别为81~154 aa和9.0~17.5 kDa;均具有C末端保守基序(VSKRKVPSGPBPJHN);除了ItfCLE2和ItfCLE6,均为不稳定蛋白;除了ItfCLE5,均为亲水性脂溶蛋白;亚细胞定位表明均为胞外分泌型小肽。进化分析表明这12个CLE多肽属于5个不同的亚组。表达模式分析表明,各ItfCLE基因在不同组织中的表达不同,ItfCLE9和ItfCLE10在花中表达较高,ItfCLE4和ItfCLE12在根中表达较高,ItfCLE2、ItfCLE6和ItfCLE8在茎中表达较高;ItfCLE12基因受干旱诱导表达最高,ItfCLE8受干旱和盐胁迫诱导上调表达。进一步从甘薯栽培种济薯25中克隆ItfCLE12的同源基因IbCLE12,实时荧光定量结果表明IbCLE12受PEG6000干旱和ABA处理诱导显著上调表达,推测IbCLE12在甘薯抗旱性中发挥重要的调控作用。本研究结果可为进一步解析甘薯CLE多肽家族功能及IbCLE12基因在甘薯抗旱性中的分子机制奠定基础。

  • 相关文献

[1]大白菜LACS家族基因鉴定与表达分析. 王荣花,王树彬,刘栓桃,张志刚,李巧云,王立华,赵智中. 2022

[2]陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 陈义珍,李浩,傅明川,王立国,刘任重,柳展基. 2023

[3]不同甘薯品种抗旱性评价及耐旱指标筛选. 张海燕,解备涛,汪宝卿,董顺旭,段文学,张立明. 2019

[4]水分胁迫对不同抗旱型核桃幼苗叶绿素荧光参数的影响. 相昆,张美勇,徐颖,李宪利. 2009

[5]葡萄干旱胁迫反应机理的研究进展. 张加魁,王恒振,史红梅. 2009

[6]葡萄干旱胁迫反应机理的研究进展. 张加魁,王恒振,史红梅. 2009

[7]洋葱伯克霍尔德氏菌CAS19嗜铁素合成相关基因cepR的克隆及生物信息分析. 杨芩,余贤美,贺春萍,郑服丛. 2010

[8]麻核桃CBF基因的克隆与生物信息学分析. 张建朋,张士刚,陈新,徐丽,贾建云,张力思,刘庆忠. 2013

[9]栽培种花生FAE1基因的克隆和序列分析. 张欣,孙全喜,吴琪,王秀贞,胡东青,唐月异,王志伟,宋国生,徐建志,殷冬梅,王传堂. 2018

[10]桃已知MADS-box转录因子的生物信息学及花发育表达分析. 王传增,余贤美,董庆龙,张安宁,刘伟,董飞,王淑贞,王长君. 2015

[11]水稻类受体蛋白激酶基因OsESG1的克隆与生物信息学分析. 房孝良,刘炜. 2012

[12]两个大白菜FT基因的生物信息学解析. 李利斌,刘立锋,李化银,程玉正,高建伟. 2010

[13]大白菜GID1家族基因鉴定及表达模式分析. 宋晴晴,张慧敏,张烨,张一卉,李景娟,李化银,贺立龙,王凤德,高建伟. 2020

[14]拟南芥和大白菜LUG蛋白家族的生物信息学分析. 马宗琪,王凤德,邱念伟. 2012

[15]核桃JrCOR基因的克隆及表达分析. 徐丽,陈新,张力思,魏海蓉,刘庆忠. 2018

[16]花生线粒体型苹果酸脱氢酶基因AhMMDH1的结构与表达分析. 李鹏祥,唐桂英,徐平丽,朱洁琼,单雷,万书波. 2020

[17]花生FAD基因家族的全基因组鉴定与表达模式分析. 阮建,单雷,李新国,郭峰,孟静静,万书波,彭振英. 2018

[18]燕山葡萄MAPK基因的克隆、亚细胞定位及表达分析. 朱自果,张庆田,李秀杰,韩真,李桂荣,李勃. 2020

[19]一种新的牛支原体膜蛋白p59的表达与鉴定. 蒋仁新,王基隆,朱曼玲,程凯慧,解晓莉,杨宏军,丁家波,刘磊,张亮. 2019

[20]蓝莓角鲨烯环氧化酶基因的克隆与表达分析. 陈新,徐丽,张力思,宗晓娟,魏海蓉,王甲威,谭钺,朱东姿,洪坡,刘庆忠. 2019

作者其他论文 更多>>